250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0473 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0473  inner-membrane translocator  100 
 
 
298 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.994417 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6160  ABC transporter, inner membrane subunit  97.32 
 
 
298 aa  564  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2217  inner-membrane translocator  97.65 
 
 
298 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2830  inner-membrane translocator  97.65 
 
 
298 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2841  inner-membrane translocator  97.65 
 
 
298 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1314  inner-membrane translocator  91.95 
 
 
298 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.506841  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0441  ABC transporter, permease protein  93.96 
 
 
339 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0285978  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3141  ABC transporter, permease protein  93.29 
 
 
298 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0688  branched chain amino acid ABC transporter permease  93.29 
 
 
336 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.489758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0110  ABC transporter, permease protein  93.29 
 
 
298 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1478  ABC transporter, permease protein  93.29 
 
 
298 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0506  ABC transporter, permease protein  93.29 
 
 
298 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.973872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0523  ABC transporter, permease protein  93.29 
 
 
298 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2906  ABC transporter, permease protein  93.29 
 
 
298 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1210  inner-membrane translocator  90.27 
 
 
298 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1503  inner-membrane translocator  83.96 
 
 
302 aa  474  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.26589  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1462  inner-membrane translocator  83.22 
 
 
302 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  hitchhiker  0.000000733363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1739  putative transmembrane ABC transporter protein  83.61 
 
 
303 aa  471  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.210687  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1276  ABC transporter permease  77.55 
 
 
296 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14380  ABC transporter permease  77.55 
 
 
296 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.515362  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1749  inner-membrane translocator  76.45 
 
 
295 aa  418  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3142  inner-membrane translocator  75.77 
 
 
293 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.407597  normal  0.74462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1948  inner-membrane translocator  76.37 
 
 
295 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418082  normal  0.372623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4312  inner-membrane translocator  74.15 
 
 
294 aa  415  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.953267  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1950  inner-membrane translocator  76.53 
 
 
296 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.202411  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2039  inner-membrane translocator  74.32 
 
 
313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0264556 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2105  inner-membrane translocator  63.51 
 
 
312 aa  346  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  60.94 
 
 
299 aa  332  5e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  61.28 
 
 
299 aa  332  5e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1713  inner-membrane translocator  62.08 
 
 
299 aa  329  4e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.376915  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0822  ABC transporter inner-membrane translocator  55.44 
 
 
299 aa  322  4e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0113178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1088  inner-membrane translocator  59.33 
 
 
300 aa  312  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2055  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  57.09 
 
 
294 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1975  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  57.09 
 
 
294 aa  298  5e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0866  inner-membrane translocator  57.79 
 
 
294 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4045  inner-membrane translocator  59.23 
 
 
292 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3066  inner-membrane translocator  57.99 
 
 
292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3722  inner-membrane translocator  59.23 
 
 
292 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  53.54 
 
 
295 aa  280  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2868  inner-membrane translocator  54.7 
 
 
294 aa  279  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02939  hypothetical protein  51.36 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  50.85 
 
 
315 aa  271  7e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002971  ABC-type uncharacterized transport system permease component  51.01 
 
 
311 aa  271  9e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0620  putative ABC transporter, permease protein  53.22 
 
 
327 aa  266  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.375886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  49.13 
 
 
306 aa  248  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000156701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  47.17 
 
 
325 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0324  hypothetical protein  47.59 
 
 
304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2861  inner-membrane translocator  50.17 
 
 
313 aa  239  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2855  inner-membrane translocator  50 
 
 
330 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  51.1 
 
 
329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  50.52 
 
 
302 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000114262  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0048  ABC transporter, permease protein  46.71 
 
 
297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1474  inner-membrane translocator  48.65 
 
 
330 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  43.64 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4552  inner-membrane translocator  43.92 
 
 
305 aa  215  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.131035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  46.18 
 
 
307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2226  inner-membrane translocator  44.84 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0342549  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  43.16 
 
 
305 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  43.16 
 
 
305 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  48.75 
 
 
640 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.2 
 
 
299 aa  209  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  42.66 
 
 
306 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  44.24 
 
 
299 aa  201  9e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.55 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  45.35 
 
 
308 aa  199  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0211  ABC transporter, permease protein, putative  43.3 
 
 
303 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193865  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0043  inner-membrane translocator  41.28 
 
 
289 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.963469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1946  inner-membrane translocator  46.05 
 
 
299 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.463281  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2363  inner-membrane translocator  33.14 
 
 
365 aa  187  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000240422  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.75 
 
 
289 aa  185  7e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000049546  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  39.72 
 
 
298 aa  185  8e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  41.58 
 
 
287 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0206  inner-membrane translocator  33.72 
 
 
363 aa  172  5e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0724  inner-membrane translocator  38.89 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0737  inner-membrane translocator  39.26 
 
 
300 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000122382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1099  inner-membrane translocator  35.62 
 
 
329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  40 
 
 
584 aa  144  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4372  inner-membrane translocator  39.3 
 
 
299 aa  136  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2839  ABC transporter permease  60.2 
 
 
120 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198537  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0477  putative sugar ABC transporter permease  31.28 
 
 
339 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.844394  normal  0.0733402 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4066  monosaccharide-transporting ATPase  31.28 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0149  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.28 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.356378  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  26.48 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5160  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  29.89 
 
 
348 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6561  Monosaccharide-transporting ATPase  31.46 
 
 
352 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2116  monosaccharide-transporting ATPase  31.67 
 
 
340 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.326273  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  25 
 
 
338 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2042  monosaccharide-transporting ATPase  28.25 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0809219  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0074  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.11 
 
 
373 aa  54.3  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  25.19 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  25.19 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  30.4 
 
 
331 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  30.4 
 
 
331 aa  53.9  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  30.4 
 
 
331 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1973  inner-membrane translocator  31.86 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  28.78 
 
 
365 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0915  inner-membrane translocator  29.5 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  31.76 
 
 
342 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2883  inner-membrane translocator  28.19 
 
 
348 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.797919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  30.26 
 
 
331 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0102816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>