More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0456 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  86.84 
 
 
525 aa  894    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  76.07 
 
 
557 aa  828    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  86.83 
 
 
517 aa  880    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  86.84 
 
 
525 aa  894    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
532 aa  1088    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  93.08 
 
 
535 aa  947    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  93.07 
 
 
531 aa  963    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  86.83 
 
 
517 aa  880    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  87.59 
 
 
525 aa  913    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  77.21 
 
 
544 aa  808    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  93.23 
 
 
532 aa  965    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  78.37 
 
 
538 aa  820    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  86.83 
 
 
517 aa  880    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  93.23 
 
 
532 aa  964    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  93.27 
 
 
535 aa  949    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  86.84 
 
 
525 aa  894    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  86.84 
 
 
525 aa  894    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  93.42 
 
 
532 aa  966    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  71.54 
 
 
418 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  70.53 
 
 
418 aa  591  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  73.46 
 
 
390 aa  568  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  65.63 
 
 
421 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  64.86 
 
 
422 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  65.64 
 
 
385 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  63.97 
 
 
385 aa  510  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  62.57 
 
 
398 aa  490  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  61.25 
 
 
380 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  59.74 
 
 
389 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  59.74 
 
 
389 aa  481  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  58.97 
 
 
389 aa  478  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  59.5 
 
 
402 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  60.41 
 
 
390 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  60.8 
 
 
388 aa  463  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  58.63 
 
 
377 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  56.28 
 
 
377 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  60.81 
 
 
400 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  60.7 
 
 
401 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  59.12 
 
 
392 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  57.31 
 
 
382 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  47.16 
 
 
524 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  47.04 
 
 
405 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  50.39 
 
 
513 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  51.84 
 
 
373 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  50.26 
 
 
524 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  49.74 
 
 
521 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  49.61 
 
 
512 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  46.4 
 
 
518 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  50.13 
 
 
528 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  50.29 
 
 
375 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  50.71 
 
 
374 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  47.76 
 
 
513 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  50.29 
 
 
375 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  46.01 
 
 
523 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  47.76 
 
 
513 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  48.01 
 
 
513 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  50.29 
 
 
375 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  50.7 
 
 
518 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  50.42 
 
 
518 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  47.04 
 
 
511 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 
375 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  50.7 
 
 
518 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  46.9 
 
 
513 aa  364  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  47.12 
 
 
520 aa  363  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  47.58 
 
 
375 aa  362  9e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  45.76 
 
 
384 aa  361  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  48.55 
 
 
374 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  45.24 
 
 
387 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  45.48 
 
 
374 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  46.8 
 
 
366 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  47.34 
 
 
401 aa  353  5.9999999999999994e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  47.34 
 
 
401 aa  353  5.9999999999999994e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  47.34 
 
 
519 aa  350  5e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  50 
 
 
356 aa  347  4e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  46.7 
 
 
401 aa  346  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  45.1 
 
 
385 aa  345  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  41.78 
 
 
378 aa  336  5e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  43.67 
 
 
388 aa  316  7e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  46.07 
 
 
377 aa  309  8e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  46.15 
 
 
311 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  39.72 
 
 
380 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  48.32 
 
 
281 aa  261  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  44.7 
 
 
308 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  45.17 
 
 
320 aa  242  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  39.49 
 
 
279 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  39.85 
 
 
284 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  39.78 
 
 
284 aa  191  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  37.97 
 
 
304 aa  189  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  38.99 
 
 
294 aa  186  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0730  cytochrome c oxidase, subunit II  36.3 
 
 
295 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.255439  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  38.55 
 
 
304 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4588  cytochrome-c oxidase  40.23 
 
 
284 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  37.7 
 
 
288 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  38.74 
 
 
285 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  39.29 
 
 
343 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  36.08 
 
 
255 aa  181  2.9999999999999997e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1140  cytochrome c oxidase subunit II  39.18 
 
 
270 aa  179  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  36.12 
 
 
279 aa  176  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  36.12 
 
 
279 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  36.12 
 
 
279 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  38.6 
 
 
254 aa  175  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>