More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0202 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  95.52 
 
 
446 aa  819  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  92.83 
 
 
446 aa  812  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  3.05819e-05 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  72.77 
 
 
450 aa  641  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0296  d-galactonate transporter  94.39 
 
 
446 aa  779  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106935  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0202  d-galactonate transporter  100 
 
 
446 aa  885  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317635  unclonable  9.05697e-12 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  92.83 
 
 
446 aa  813  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0277  d-galactonate transporter  93.95 
 
 
446 aa  779  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2810  D-galactonate transporter  94.39 
 
 
446 aa  779  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  74.25 
 
 
450 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  74.25 
 
 
450 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  72.77 
 
 
451 aa  622  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  64.38 
 
 
445 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  62.47 
 
 
461 aa  581  1e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  64.73 
 
 
463 aa  582  1e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  64.35 
 
 
454 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  64.35 
 
 
454 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  62.24 
 
 
461 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  62.36 
 
 
468 aa  574  1e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  64.04 
 
 
453 aa  575  1e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  60 
 
 
450 aa  573  1e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  61.57 
 
 
451 aa  573  1e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  64.04 
 
 
454 aa  573  1e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  60.22 
 
 
450 aa  573  1e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  60.67 
 
 
450 aa  569  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  60.45 
 
 
450 aa  568  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  60.45 
 
 
450 aa  568  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  60.45 
 
 
450 aa  568  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  60.45 
 
 
450 aa  568  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  61.66 
 
 
452 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  60.45 
 
 
450 aa  568  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  63.84 
 
 
451 aa  567  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  60.45 
 
 
450 aa  568  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  60.45 
 
 
450 aa  568  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  61.66 
 
 
452 aa  564  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  61.66 
 
 
452 aa  564  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  61.43 
 
 
440 aa  561  1e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  61.66 
 
 
452 aa  564  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  61.66 
 
 
452 aa  564  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6596  d-galactonate transporter  63 
 
 
457 aa  561  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143418  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  59.55 
 
 
450 aa  549  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  60.55 
 
 
458 aa  547  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0841  d-galactonate transporter  59.78 
 
 
450 aa  545  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  59.23 
 
 
450 aa  540  1e-152  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  59.47 
 
 
485 aa  539  1e-152  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  59.25 
 
 
485 aa  540  1e-152  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  59.6 
 
 
459 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  59.23 
 
 
450 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  59.56 
 
 
458 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  55.81 
 
 
444 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  55.13 
 
 
444 aa  531  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  55.13 
 
 
444 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3044  D-galactonate transporter  59.16 
 
 
464 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  55.13 
 
 
444 aa  531  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  55.13 
 
 
444 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  55.13 
 
 
444 aa  531  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5322  d-galactonate transporter  59.16 
 
 
464 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  55.13 
 
 
444 aa  531  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  55.13 
 
 
444 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  55.13 
 
 
444 aa  531  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  59.72 
 
 
453 aa  516  1e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4946  d-galactonate transporter  59.58 
 
 
435 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.899086  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1217  d-galactonate transporter  56.38 
 
 
446 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26743  normal  0.06903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  51.88 
 
 
447 aa  466  1e-130  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  51.13 
 
 
447 aa  459  1e-128  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  52.09 
 
 
455 aa  458  1e-128  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  51.75 
 
 
454 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  51.75 
 
 
454 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  51.28 
 
 
454 aa  452  1e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  51.52 
 
 
454 aa  453  1e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  47.67 
 
 
438 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  45.83 
 
 
436 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  45.83 
 
 
436 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  45.83 
 
 
436 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4084  probable glucarate transporter  45.83 
 
 
436 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.463281  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  42.52 
 
 
442 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.99 
 
 
456 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  42.02 
 
 
447 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  41.28 
 
 
449 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  41.8 
 
 
447 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  41.8 
 
 
447 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  41.12 
 
 
436 aa  362  7e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  40.23 
 
 
436 aa  358  1e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  41.29 
 
 
450 aa  357  2e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  41.38 
 
 
467 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  40.17 
 
 
455 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 
458 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  40.92 
 
 
478 aa  353  3e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  41.42 
 
 
446 aa  352  6e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  41.82 
 
 
449 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  41.42 
 
 
446 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  41.45 
 
 
434 aa  352  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  41.96 
 
 
448 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  39.61 
 
 
449 aa  348  9e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  41.84 
 
 
444 aa  345  7e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  42.29 
 
 
449 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  39.12 
 
 
429 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  42.59 
 
 
448 aa  340  3e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  42.59 
 
 
448 aa  340  3e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.59 
 
 
448 aa  340  3e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  42.59 
 
 
448 aa  340  3e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>