193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0201 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0216  glucarate dehydratase  95.26 
 
 
465 aa  830  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3396  glucarate dehydratase  94.61 
 
 
465 aa  840  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1214  D-glucarate dehydratase  75.22 
 
 
464 aa  710  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0710823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0663  glucarate dehydratase  68.18 
 
 
451 aa  641  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5152  glucarate dehydratase  69.1 
 
 
461 aa  639  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4583  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  80.26 
 
 
469 aa  718  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674394  normal  0.416536 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0276  glucarate dehydratase  93.97 
 
 
465 aa  833  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815006 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0224  glucarate dehydratase  95.26 
 
 
465 aa  829  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115995 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0829  glucarate dehydratase protein  75.76 
 
 
445 aa  665  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0295  glucarate dehydratase  95.04 
 
 
465 aa  822  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0201  glucarate dehydratase  100 
 
 
465 aa  942  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203534  unclonable  1.15228e-11 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4449  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  80.26 
 
 
469 aa  718  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644266  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2811  glucarate dehydratase  95.04 
 
 
465 aa  822  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4757  glucarate dehydratase  66.96 
 
 
448 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00282791  hitchhiker  0.00286979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4631  glucarate dehydratase  66.96 
 
 
451 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139469  hitchhiker  0.000950159 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0843  glucarate dehydratase  64.94 
 
 
446 aa  627  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4766  glucarate dehydratase  66.67 
 
 
451 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1011  glucarate dehydratase  66.81 
 
 
456 aa  624  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3421  D-glucarate dehydratase  66.3 
 
 
444 aa  621  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36134  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0946  glucarate dehydratase  66.74 
 
 
456 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189357  normal  0.0818467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3721  D-glucarate dehydratase  65.8 
 
 
447 aa  618  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0809  glucarate dehydratase  64.35 
 
 
446 aa  620  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3395  glucarate dehydratase  64.35 
 
 
446 aa  618  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3555  glucarate dehydratase  64.77 
 
 
446 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7096  glucarate dehydratase  67.9 
 
 
450 aa  615  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4275  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  68.71 
 
 
450 aa  608  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2142  glucarate dehydratase  68.71 
 
 
450 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1139  glucarate dehydratase  68.49 
 
 
450 aa  606  1e-172  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0684  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  68.49 
 
 
450 aa  606  1e-172  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1163  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  68.49 
 
 
450 aa  606  1e-172  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1079  glucarate dehydratase protein  66.08 
 
 
453 aa  603  1e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1041  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  68.05 
 
 
450 aa  601  1e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6488  (D)-glucarate dehydratase 1  64.92 
 
 
451 aa  602  1e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1731  glucarate dehydratase  64.27 
 
 
451 aa  601  1e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00228751  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1130  glucarate dehydratase  65.21 
 
 
444 aa  602  1e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3120  glucarate dehydratase  66.01 
 
 
450 aa  603  1e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1045  glucarate dehydratase  67.83 
 
 
450 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.567238 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6530  glucarate dehydratase  67.25 
 
 
449 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124321  normal  0.118965 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6204  glucarate dehydratase  67.4 
 
 
451 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.254671 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3091  glucarate dehydratase  63.46 
 
 
446 aa  598  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00700735  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3182  glucarate dehydratase  63.24 
 
 
446 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.475312  normal  0.651115 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0925  glucarate dehydratase  63.24 
 
 
446 aa  596  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2931  glucarate dehydratase  63.02 
 
 
446 aa  595  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.923462  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3119  glucarate dehydratase  63.24 
 
 
446 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3166  glucarate dehydratase  63.24 
 
 
446 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.193762  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4047  glucarate dehydratase  63.24 
 
 
446 aa  596  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02632  (D)-glucarate dehydratase 1  63.02 
 
 
446 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3285  glucarate dehydratase  65.13 
 
 
450 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0901  glucarate dehydratase  63.24 
 
 
446 aa  596  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3101  glucarate dehydratase  63.24 
 
 
446 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02594  hypothetical protein  63.02 
 
 
446 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3280  glucarate dehydratase  63.24 
 
 
446 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0970  D-glucarate dehydratase  64.5 
 
 
450 aa  592  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.886707  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3623  glucarate dehydratase  64.99 
 
 
451 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3086  glucarate dehydratase  63.02 
 
 
446 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0151  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4102  glucarate dehydratase  66.74 
 
 
449 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3240  D-glucarate dehydratase  62.8 
 
 
446 aa  592  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0783146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2925  glucarate dehydratase  62.8 
 
 
446 aa  592  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0539  glucarate dehydratase  66.3 
 
 
449 aa  589  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492128  normal  0.504058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1216  D-glucarate dehydratase  66.16 
 
 
449 aa  581  1e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529304  normal  0.0486159 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0189  glucarate dehydratase  67.24 
 
 
457 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1118  glucarate dehydratase  66.22 
 
 
444 aa  579  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958385 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3715  D-glucarate dehydratase  67.54 
 
 
456 aa  575  1e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.352997  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1017  glucarate dehydratase  61.96 
 
 
445 aa  565  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0552689  normal  0.150619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2393  glucarate dehydratase  64.33 
 
 
444 aa  566  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.617772  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0842  Glucarate dehydratase  60.39 
 
 
453 aa  561  1e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.545959  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0808  Glucarate dehydratase  61.27 
 
 
461 aa  555  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0834  D-glucarate dehydratase  65.21 
 
 
451 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608839  normal  0.0271686 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0349  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.82 
 
 
442 aa  553  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3241  D-glucarate dehydratase  62.06 
 
 
447 aa  551  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0695422 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3183  glucarate dehydratase  60.96 
 
 
446 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.558486 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3167  glucarate dehydratase  60.96 
 
 
446 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.153553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3120  glucarate dehydratase  60.75 
 
 
446 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.796929 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3102  glucarate dehydratase  60.61 
 
 
446 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2926  glucarate dehydratase  58.77 
 
 
446 aa  541  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02595  hypothetical protein  58.77 
 
 
446 aa  540  1e-152  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02633  predicted glucarate dehydratase  58.77 
 
 
446 aa  540  1e-152  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0900  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.77 
 
 
446 aa  540  1e-152  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2932  glucarate dehydratase  58.77 
 
 
446 aa  540  1e-152  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0248  glucarate dehydratase  61.26 
 
 
445 aa  539  1e-152  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3556  Glucarate dehydratase  60.04 
 
 
450 aa  539  1e-152  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3092  glucarate dehydratase  58.55 
 
 
446 aa  537  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.026036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3396  Glucarate dehydratase  59.83 
 
 
450 aa  537  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0924  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.42 
 
 
446 aa  537  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1790  Glucarate dehydratase  60.87 
 
 
445 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1990  glucarate dehydratase  60.87 
 
 
445 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202051  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2497  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  61.71 
 
 
441 aa  524  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0446  Glucarate dehydratase  62.82 
 
 
432 aa  516  1e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2481  glucarate dehydratase  54.82 
 
 
441 aa  501  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762164  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1407  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.18 
 
 
429 aa  243  4e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0463415  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1068  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.29 
 
 
434 aa  243  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6284  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.4 
 
 
424 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2911  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  34.61 
 
 
424 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2716  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.38 
 
 
424 aa  233  4e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734376  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3283  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.4 
 
 
424 aa  233  8e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2486  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  33.33 
 
 
422 aa  232  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4200  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.37 
 
 
421 aa  230  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.370116  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0035  glucarate dehydratase  66.23 
 
 
186 aa  225  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1029  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.25 
 
 
419 aa  223  5e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.250337  normal  0.268513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0035  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.27 
 
 
433 aa  222  1e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45154 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>