More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0129 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
294 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  95.24 
 
 
296 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  94.9 
 
 
296 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  94.56 
 
 
294 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  94.22 
 
 
294 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  94.56 
 
 
294 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  94.22 
 
 
294 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2016  LysR family transcriptional regulator  62.59 
 
 
297 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  56.27 
 
 
297 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3751  transcriptional regulator, LysR family  55.1 
 
 
298 aa  322  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.587681  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0915  transcriptional regulator, LysR family  55.25 
 
 
314 aa  320  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35890  Regulatory protein, LysR family  54.08 
 
 
309 aa  315  7e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3565  transcriptional regulator, LysR family  54.08 
 
 
298 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3033  LysR family transcriptional regulator  53.06 
 
 
305 aa  308  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0273235  normal  0.89504 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1818  LysR family transcriptional regulator  52.92 
 
 
297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4908  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 
299 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2638  LysR family transcriptional regulator  52.9 
 
 
294 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5921  LysR family transcriptional regulator  54.61 
 
 
294 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2590  LysR family transcriptional regulator  52.9 
 
 
294 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1980  LysR family transcriptional regulator  52.9 
 
 
294 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17760  Transcriptional regulator, LysR family  51.53 
 
 
299 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0707  LysR family transcriptional regulator  53.24 
 
 
294 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256747  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2614  LysR family transcriptional regulator  52.56 
 
 
294 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  48.3 
 
 
298 aa  291  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3691  LysR family transcriptional regulator  51.36 
 
 
299 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0979  LysR family transcriptional regulator  51.38 
 
 
307 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039685  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0880  LysR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
294 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.803519  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0339  LysR family transcriptional regulator  52.04 
 
 
294 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1042  LysR family transcriptional regulator  52.04 
 
 
294 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0086  LysR family transcriptional regulator  52.04 
 
 
294 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2473  LysR family transcriptional regulator  52.04 
 
 
294 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0638  LysR family transcriptional regulator  52.04 
 
 
294 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0883  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 
294 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.427217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2944  putative transcriptional regulator  51.02 
 
 
297 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625117  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  47.59 
 
 
305 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34690  LysR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
297 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0262778  normal  0.106193 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0459  transcriptional regulator, LysR family  49.32 
 
 
297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3137  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
323 aa  281  8.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1454  LysR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
296 aa  279  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.508797  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3196  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 
304 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00241672  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3304  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
313 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0884385 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0231  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 
300 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0401  transcriptional regulator, LysR family  50.34 
 
 
299 aa  272  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0508531  normal  0.660201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1997  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 
298 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4096  transcriptional regulator, LysR family  47.62 
 
 
308 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6823  LysR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
308 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1711  transcriptional regulator, LysR family  45.92 
 
 
300 aa  249  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.530913  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3280  LysR family transcriptional regulator  76.62 
 
 
156 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  44.22 
 
 
305 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 
334 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
304 aa  229  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 
342 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  41.38 
 
 
315 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 
314 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  42.12 
 
 
334 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
334 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
334 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
334 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
334 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  43.05 
 
 
335 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
334 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
334 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 
334 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 
310 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
303 aa  226  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 
314 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
334 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
295 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  42.37 
 
 
300 aa  225  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
334 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
334 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 
334 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
334 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 
334 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 
334 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
334 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
306 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5951  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
305 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 
297 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4738  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
306 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.44438  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  42.18 
 
 
297 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
335 aa  223  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.37 
 
 
302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2356  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 
307 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118407  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 
303 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6256  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 
303 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 
299 aa  219  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
298 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4093  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 
344 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09910  putative transcriptional regulator  40.14 
 
 
307 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280275  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
303 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
303 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0833  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 
300 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  41.36 
 
 
301 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 
324 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2413  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 
323 aa  216  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>