170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3881 on replicon NC_010578
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  100 
 
 
356 aa  709    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  37.46 
 
 
339 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  36.9 
 
 
367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  37.46 
 
 
338 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  35.31 
 
 
342 aa  159  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  34.22 
 
 
354 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  32.77 
 
 
344 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  35.1 
 
 
356 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  34.78 
 
 
383 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  34.49 
 
 
344 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  36.58 
 
 
335 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  32.55 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  32.94 
 
 
333 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  33.52 
 
 
344 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  36 
 
 
354 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  31.96 
 
 
342 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  36.08 
 
 
363 aa  142  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  31.37 
 
 
367 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  33.43 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  36.18 
 
 
327 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  33.55 
 
 
346 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  32.5 
 
 
378 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  33.15 
 
 
354 aa  135  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  33.24 
 
 
360 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  34.89 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  33.89 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  32.94 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  34.49 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  39.51 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  35.69 
 
 
362 aa  126  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  32.66 
 
 
348 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  33.99 
 
 
366 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  32.97 
 
 
364 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  32.39 
 
 
335 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  35.17 
 
 
336 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  32.97 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  30.88 
 
 
351 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  29.41 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  32.3 
 
 
384 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  27.78 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  29.81 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  32.14 
 
 
357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  30.17 
 
 
379 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  31.5 
 
 
356 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  29.97 
 
 
359 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  32.11 
 
 
376 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  31.32 
 
 
356 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  28.04 
 
 
377 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  31.19 
 
 
357 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  31.29 
 
 
375 aa  90.1  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  28.75 
 
 
354 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  36 
 
 
368 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  28.12 
 
 
395 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  28.12 
 
 
395 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  30 
 
 
362 aa  86.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  28.98 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  28.94 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  27.84 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  29.61 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  25.53 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  32.09 
 
 
351 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  26.95 
 
 
372 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  31.32 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  28.93 
 
 
695 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  25.27 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  26.12 
 
 
359 aa  63.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  27.49 
 
 
637 aa  62.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  33.92 
 
 
358 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  26.06 
 
 
660 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  26.27 
 
 
660 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  24.76 
 
 
348 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  24.69 
 
 
395 aa  56.2  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  26.24 
 
 
349 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  25.48 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  30.92 
 
 
353 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  28.14 
 
 
366 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  23.67 
 
 
658 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1075  putative acyltransferase  32.45 
 
 
352 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  25.15 
 
 
393 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  30.28 
 
 
382 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  27.55 
 
 
376 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0593  acyltransferase 3  26.38 
 
 
339 aa  53.1  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0732  hypothetical protein  31.25 
 
 
398 aa  53.1  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  25.38 
 
 
385 aa  53.1  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0976  acyltransferase 3  27.12 
 
 
402 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207493  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  30.86 
 
 
378 aa  52.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  27.44 
 
 
423 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  26.78 
 
 
656 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1300  acyltransferase 3  28.57 
 
 
374 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  28.48 
 
 
384 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  29.1 
 
 
642 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  35.65 
 
 
437 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  28.06 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0113  acyltransferase 3  36.49 
 
 
564 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659313  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  29.41 
 
 
363 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  25.44 
 
 
307 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  29.59 
 
 
360 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  30.25 
 
 
376 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  27.53 
 
 
685 aa  49.7  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1006  acyltransferase 3  30.51 
 
 
366 aa  49.3  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>