25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3876 on replicon NC_010578
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010578  Bind_3876  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  638    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.31832  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1635  hypothetical protein  64.55 
 
 		 299 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464556 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0773  hypothetical protein  34.9 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3002  hypothetical protein  43.05 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44522  predicted protein  35.86 
 
 		 352 aa  139  7.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.431246  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1902  hypothetical protein  35.54 
 
 		 279 aa  133  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1651  hypothetical protein  32.23 
 
 		 268 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00915385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2547  proline hydroxylase-like protein  32.05 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.259291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3077  hypothetical protein  33.64 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3313  hypothetical protein  33.49 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0640  hypothetical protein  28.99 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5183  proline hydroxylase-like protein  29.24 
 
 		 323 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000154624 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5796  hypothetical protein  28.74 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0059  hypothetical protein  21.1 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382992  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0041  2OG-Fe(II) oxygenase  30.69 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0255  2OG-Fe(II) oxygenase  26.79 
 
 		 251 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.791217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0453  2OG-Fe(II) oxygenase  38.89 
 
 		 217 aa  46.6  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2243  2OG-Fe(II) oxygenase  31 
 
 		 226 aa  46.2  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07554  oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14810)  28.16 
 
 		 663 aa  45.8  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  hitchhiker  0.00734337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1851  hypothetical protein  26.78 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2920  oxidoreductase  34.31 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0963  2OG-Fe(II) oxygenase  36.92 
 
 		 224 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0704463  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1909  2OG-Fe(II) oxygenase  30.61 
 
 		 220 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270235 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2032  2OG-Fe(II) oxygenase  36.76 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1617  2OG-Fe(II) oxygenase  34.33 
 
 		 219 aa  42.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>