More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3825 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 204 aa  423  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  96.08 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  66.16 
 
 		 203 aa  290  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  59.3 
 
 		 208 aa  259  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  58 
 
 		 208 aa  256  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  51.5 
 
 		 203 aa  248  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  51.5 
 
 		 203 aa  247  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  50.75 
 
 		 203 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  61.11 
 
 		 181 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  50.5 
 
 		 203 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  51.91 
 
 		 194 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  51.91 
 
 		 194 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  48.91 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  46.23 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  48.6 
 
 		 192 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  44.12 
 
 		 203 aa  197  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9030  hypothetical protein  40.38 
 
 		 241 aa  91.7  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  39.08 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  29.03 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  26.2 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  36.11 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  36.11 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0292  isochorismatase family protein  26.74 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  36.11 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  43.84 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  23.12 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  38.67 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  31.09 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  31.78 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  21.38 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  31.4 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  30.25 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  31.13 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  27.74 
 
 		 233 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  33.77 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  30.58 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  40 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3140  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  26.7 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 227 aa  52  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  37.65 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  35.06 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1499  isochorismatase hydrolase  37.27 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  35.56 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  25.57 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2761  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  31.03 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1289  isochorismatase hydrolase  37.33 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.189342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  30.07 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_8142  predicted protein  36 
 
 		 96 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1277  isochorismatase hydrolase  28.24 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42350  Isochorismatase hydrolase  28.05 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1197  isochorismatase hydrolase  39.73 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.788349  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 		 172 aa  50.1  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  28.05 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  27.11 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  32.39 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  34.88 
 
 		 247 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  27.59 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  33.78 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  35.48 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2458  isochorismatase hydrolase  44.07 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  41.79 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  24.06 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06631  isochorismatase hydrolase family protein  30.77 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  36.46 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1787  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1834  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  36.99 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  36.23 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  25.53 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3976  isochorismatase superfamily hydrolase  31.33 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.137258 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0636  isochorismatase hydrolase family protein  31.4 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.521489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  26.88 
 
 		 241 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  40.91 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  26.83 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06921  isochorismatase hydrolase family protein  28.57 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.467338  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1858  isochorismatase hydrolase  31.33 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0263508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>