121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3754 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3754  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.17 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.24 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  26.39 
 
 		 309 aa  68.6  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.05 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  25.23 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0431  partition protein  27.18 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.21 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.572043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  31.29 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.19 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  25.96 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.82 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  26.61 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.29 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.72 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.72 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.31 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.72 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.35 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  29.81 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0009  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.91 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.363565  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.91 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.91 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0098  partition protein  25.11 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10243  normal  0.0389744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.91 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  23.72 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03580  partition protein  24.2 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.82 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  23.85 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.67 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.67 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.61 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.88 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  23.26 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  23.26 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  25.79 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  23.26 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  23.26 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  23.26 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  23.26 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  23.26 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.14 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.79 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.79 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.29 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.79 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  27.78 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  24.17 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.97 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4402  hypothetical protein  31.2 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0107502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  26.51 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.74 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.32 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.85 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3136  putative partition-related protein  24.04 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0178894  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0550  putative partition-related protein  27.19 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.840811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.36 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.503731  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.57 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.76 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5082  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.99 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161986 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.15 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.17 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.53 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.34 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2118  ATPase  32.04 
 
 		 275 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.615389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3113  hypothetical protein  24.37 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3002  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  28.03 
 
 		 293 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.150485 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.13 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.62 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.39 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  27.34 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  29.84 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  23.7 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_08  DNA-binding protein, putative plasmid partition protein  28.8 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0337  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  28.28 
 
 		 269 aa  45.4  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00565629  normal  0.707159 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2122  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  29.03 
 
 		 199 aa  45.1  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.617804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.06 
 
 		 264 aa  45.1  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000118454  unclonable  0.000000000458103 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3553  hypothetical protein  31.71 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346418  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2483  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  57.89 
 
 		 435 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.111676  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4322  hypothetical protein  57.89 
 
 		 435 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131093 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.23 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  33.07 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.66 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.47 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  40.82 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.34 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6265  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 		 280 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  40.82 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.87 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.79 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0108  hypothetical protein  28.15 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.327497  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20580  hypothetical protein  23.72 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.91305  normal  0.247088 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.68 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5043  hypothetical protein  44.9 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000269108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.87 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2658  hypothetical protein  24.17 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>