34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3686 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010580  Bind_3686  DotL  100 
 
 
786 aa  1598  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00900266  normal  0.235831 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0488  hypothetical protein  35.89 
 
 
783 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0512  hypothetical protein  35.52 
 
 
783 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0366  IcmO  32.25 
 
 
792 aa  372  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1816  IcmO protein  32.25 
 
 
792 aa  372  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0057  hypothetical protein  32.72 
 
 
952 aa  290  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.889998  hitchhiker  0.00629192 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0122  putative type IV secretion system protein IcmO/DotL  28.7 
 
 
934 aa  250  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4265  hypothetical protein  29.88 
 
 
950 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0068  TraG/TraD family conjugal transfer protein  30.72 
 
 
762 aa  233  8e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0076  trbC protein  30.72 
 
 
762 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0075  TrbC  29.71 
 
 
763 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0356259 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0057  hypothetical protein  27.99 
 
 
590 aa  143  1e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0209487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03523  TrbC-like protein  29.58 
 
 
387 aa  125  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03474  hypothetical protein  32.23 
 
 
171 aa  67.4  9e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.481674  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1055  hypothetical protein  21.7 
 
 
659 aa  60.1  1e-07  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1016  hypothetical protein  20.25 
 
 
644 aa  58.2  5e-07  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  27.17 
 
 
589 aa  53.5  1e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0738  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  27.1 
 
 
557 aa  51.2  7e-05  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2122  TraG family protein  20.65 
 
 
464 aa  48.5  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2208  hypothetical protein  22.06 
 
 
718 aa  48.5  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395932  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1751  hypothetical protein  21.34 
 
 
743 aa  48.1  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3798  TraG family protein  30 
 
 
470 aa  48.1  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1638  hypothetical protein  21.57 
 
 
719 aa  47.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4330  hypothetical protein  22.5 
 
 
637 aa  47.8  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930628  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0448  hypothetical protein  21.96 
 
 
719 aa  46.6  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1251  lipoprotein, putative  28.57 
 
 
619 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.684077  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0673  hypothetical protein  21.65 
 
 
719 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0837  DNA transfer in the process of conjugation and F pilus assembly protein  25.84 
 
 
455 aa  45.8  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00362529  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0645  TraG-family protein  21.3 
 
 
703 aa  45.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5183  hypothetical protein  25.83 
 
 
618 aa  45.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1518  hypothetical protein  25.83 
 
 
618 aa  45.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328078  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3414  hypothetical protein  21.17 
 
 
733 aa  44.7  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41428  normal  0.0672009 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3718  hypothetical protein  20.67 
 
 
706 aa  44.7  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.387295  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3123  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.99 
 
 
1446 aa  44.3  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341793  decreased coverage  0.000461331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>