132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3512 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3512  precorrin-6x reductase  100 
 
 
255 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.42135  normal  0.748332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3120  precorrin-6A reductase  57.21 
 
 
265 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2377  cobalt-precorrin-6x reductase  50.79 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2317  cobalt-precorrin-6x reductase  51.19 
 
 
249 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.398392  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5688  precorrin-6x reductase  58.3 
 
 
250 aa  228  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0122424  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5189  precorrin-6x reductase  53.15 
 
 
273 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4722  precorrin-6x reductase  52.7 
 
 
273 aa  224  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  0.411006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3149  precorrin-6A reductase  50.43 
 
 
257 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  0.712178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1885  cobalt-precorrin-6x reductase  49.61 
 
 
259 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2154  precorrin-6x reductase  50.79 
 
 
253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0179311  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0337  cobalt-precorrin-6x reductase  48.21 
 
 
253 aa  215  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0021  cobalt-precorrin-6x reductase  49.55 
 
 
246 aa  215  7e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.342454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3181  cobalt-precorrin-6x reductase  52.7 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  0.537996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3263  precorrin-6x reductase  56.03 
 
 
253 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2814  cobalt-precorrin-6x reductase  48.78 
 
 
266 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5261  precorrin-6x reductase  54.5 
 
 
271 aa  208  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.527912  normal  0.416364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2443  precorrin-6x reductase  50.79 
 
 
253 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00747936  normal  0.0784333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0805  precorrin-6x reductase  50.8 
 
 
266 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.955549  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1548  precorrin-6x reductase  45.09 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2926  precorrin-6A reductase  45.19 
 
 
251 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.422905  hitchhiker  0.00352486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2215  precorrin-6A reductase  46.43 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1472  cobalt-precorrin-6x reductase  48.87 
 
 
247 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2825  cobalt-precorrin-6x reductase  48.87 
 
 
247 aa  191  9e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7178  cobalt-precorrin-6x reductase  51.58 
 
 
256 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.183428  normal  0.0616428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3281  precorrin-6x reductase  49.4 
 
 
287 aa  188  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  48.87 
 
 
247 aa  188  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.642834  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6023  cobalt-precorrin-6x reductase  49.41 
 
 
256 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00000257009  normal  0.17843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2739  cobalt-precorrin-6x reductase  42.15 
 
 
252 aa  188  9e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0747566  normal  0.206921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5847  precorrin-6x reductase  48.86 
 
 
249 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.760322  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6989  precorrin-6x reductase  45.06 
 
 
250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.463236  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1522  cobalt-precorrin-6x reductase  49.58 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0287326  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0256  cobalt-precorrin-6x reductase  45.95 
 
 
245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000182781  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2180  precorrin-6x reductase  46.84 
 
 
248 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0136003  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1927  precorrin-6x reductase  47.51 
 
 
253 aa  167  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338007  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2500  precorrin-6x reductase  47.53 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2628  cobalt-precorrin-6x reductase  44 
 
 
229 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12106  cobalt-precorrin-6x reductase  43.78 
 
 
244 aa  161  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165074  normal  0.705272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2478  precorrin-6x reductase  43.44 
 
 
244 aa  158  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0390699  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1886  cobalt-precorrin-6x reductase  42.68 
 
 
248 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2537  precorrin-6A reductase  45.12 
 
 
230 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.571905  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_004310  BR1299  cobalt-precorrin-6x reductase  40.72 
 
 
248 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1263  cobalt-precorrin-6x reductase  40.72 
 
 
248 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4880  precorrin-6x reductase, putative  37.01 
 
 
246 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2988  precorrin-6A reductase  46.12 
 
 
251 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.432734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1780  precorrin-6x reductase  43.38 
 
 
241 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.171878  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17710  precorrin-6A reductase  42.15 
 
 
250 aa  148  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262033  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1197  cobalt-precorrin-6x reductase  42.34 
 
 
243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1677  cobalt-precorrin-6x reductase  42.34 
 
 
243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206927  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2522  cobalt-precorrin-6x reductase  44.59 
 
 
242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4710  cobalt-precorrin-6x reductase  40.09 
 
 
239 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.54445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0566  precorrin-6x reductase  47.98 
 
 
253 aa  145  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2485  cobalt-precorrin-6x reductase  44.14 
 
 
242 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26460  cobalt-precorrin-6x reductase  42.86 
 
 
242 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00807093  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2530  cobalt-precorrin-6x reductase  44.14 
 
 
242 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5366  cobalt-precorrin-6x reductase  39.36 
 
 
242 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.791925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0601  cobalt-precorrin-6x reductase  40.53 
 
 
242 aa  141  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156008  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5478  cobalt-precorrin-6x reductase  41.35 
 
 
269 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4420  cobalt-precorrin-6x reductase  38.67 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1650  cobalt-precorrin-6x reductase  42.79 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2245  cobalt-precorrin-6x reductase  41.52 
 
 
242 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99555  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4622  cobalt-precorrin-6x reductase  40.44 
 
 
239 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44815  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2116  cobalt-precorrin-6x reductase  42.41 
 
 
244 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253146  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1954  cobalt-precorrin-6x reductase  42.41 
 
 
244 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1971  cobalt-precorrin-6x reductase  42.41 
 
 
244 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1690  precorrin-6A reductase  43.11 
 
 
248 aa  138  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0972101  normal  0.0269101 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1158  cobalt-precorrin-6x reductase  42.41 
 
 
244 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.358764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1599  cobalt-precorrin-6x reductase  42.41 
 
 
244 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00760442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0260  cobalt-precorrin-6x reductase  42.41 
 
 
244 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0900  cobalt-precorrin-6x reductase  42.41 
 
 
244 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4569  cobalt-precorrin-6x reductase  40.81 
 
 
239 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4832  cobalt-precorrin-6x reductase  40.54 
 
 
239 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0805988  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4888  cobalt-precorrin-6x reductase  41.44 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179164  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1248  cobalt-precorrin-6x reductase  37.8 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0495203  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3140  cobalt-precorrin-6x reductase  40.18 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167362  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5596  Precorrin-6A reductase  45.98 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340084  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0359  precorrin-6x reductase  41.06 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2395  cobalt-precorrin-6x reductase  40.99 
 
 
256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0310  precorrin-6A reductase  41.35 
 
 
248 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3377  precorrin-6A reductase  35.56 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.223591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0378  precorrin-6x reductase  38.21 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0176  precorrin-6x reductase  43.26 
 
 
248 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4828  cobalt-precorrin-6x reductase  43.3 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0932291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2881  precorrin-6A reductase  39.35 
 
 
243 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1565  cobalt-precorrin-6x reductase  40.99 
 
 
243 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108176  normal  0.15041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1577  cobalt-precorrin-6x reductase  41.48 
 
 
246 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0167988  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1614  precorrin-6x reductase  37.8 
 
 
239 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1595  cobalt-precorrin-6x reductase  40.41 
 
 
246 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.635785  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1276  precorrin-6x reductase  26 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0705  precorrin-6x reductase  25.55 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2748  precorrin-6x reductase  25.59 
 
 
245 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000765428  normal  0.43951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0316  precorrin-6x reductase  27.83 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  30.71 
 
 
519 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  25.71 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1287  Precorrin-6x reductase CbiJ/CobK  28.45 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0624  precorrin-6X reductase, putative  25.54 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0548238  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0210  precorrin-6x reductase/cobalamin biosynthetic protein CbiD  28.45 
 
 
602 aa  66.2  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0937  precorrin-6x reductase  30.47 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2148  cobalt-precorrin-6x reductase  28.09 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1713  precorrin-6A reductase  26.89 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1379  precorrin-6x reductase  24.89 
 
 
655 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>