153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3390 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3390  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  879    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2985  major facilitator superfamily MFS_1  45.58 
 
 		 424 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.124537 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  32.79 
 
 		 430 aa  179  8e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  32.56 
 
 		 430 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  30.58 
 
 		 427 aa  160  6e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  30.34 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  30.67 
 
 		 430 aa  156  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  30.67 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  30.77 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  30.77 
 
 		 425 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  27.98 
 
 		 428 aa  141  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  27.74 
 
 		 428 aa  139  7e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  29.25 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  29 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  26.78 
 
 		 432 aa  136  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  26.78 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  26.69 
 
 		 423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  28.94 
 
 		 426 aa  130  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  30.09 
 
 		 437 aa  128  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  27.54 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  26.4 
 
 		 423 aa  127  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  26.8 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  29.79 
 
 		 437 aa  127  6e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  26.8 
 
 		 366 aa  126  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  27.56 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  27.54 
 
 		 443 aa  123  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 432 aa  117  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  25.29 
 
 		 434 aa  116  7.999999999999999e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  24.6 
 
 		 451 aa  113  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  25.93 
 
 		 432 aa  113  9e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  24.43 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  24.32 
 
 		 452 aa  110  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  24.54 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  21.49 
 
 		 429 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  25.13 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 417 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  26.2 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  23.95 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  23.95 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  27.89 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  25.14 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0539  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000373012  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  24.38 
 
 		 406 aa  94  5e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 434 aa  93.2  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  26.67 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 445 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  25.26 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  24.52 
 
 		 427 aa  87.8  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  24.15 
 
 		 427 aa  87.4  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0779  permease, putative  28.19 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.759724  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0230  hypothetical protein  26.86 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0317148  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0838  hypothetical protein  21.33 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.0062417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0251  major facilitator family transporter  22.91 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.823307  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0846  hypothetical protein  22.81 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000055342  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1033  permease, putative  24.32 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.187473  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  20.74 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  25.17 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  21.57 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  23.36 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  25 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  25.34 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  25 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  24 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  22.56 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  23.12 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  20.58 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1823  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.262601  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  25.47 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 407 aa  54.7  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 421 aa  53.9  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 		 411 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  22.26 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  20.29 
 
 		 420 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3978  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2184  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  21.59 
 
 		 427 aa  50.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 410 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0056  major facilitator family transporter  20.88 
 
 		 395 aa  50.4  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 398 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3900  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 461 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3837  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>