105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3331 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  66.52 
 
 		 240 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  59.48 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  59.48 
 
 		 243 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  56.84 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  54.31 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  54.31 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  52.42 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  52.4 
 
 		 237 aa  241  9e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  55.41 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  54.95 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  52.89 
 
 		 231 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  52.63 
 
 		 233 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  51.08 
 
 		 235 aa  234  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  51.79 
 
 		 236 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  49.34 
 
 		 249 aa  208  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.1 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.32 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.03 
 
 		 237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  47.03 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  47.03 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.49 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.71 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  45.13 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.03 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  45.66 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.29 
 
 		 240 aa  172  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  45.21 
 
 		 213 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  41.7 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.83 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  42.08 
 
 		 214 aa  162  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.91 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.27 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  37.96 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.81 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.45 
 
 		 215 aa  148  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  40.45 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  39.45 
 
 		 229 aa  145  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  41.21 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.92 
 
 		 221 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.36 
 
 		 216 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.08 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  29.27 
 
 		 241 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  29.83 
 
 		 212 aa  95.5  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  30.27 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.2 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  30 
 
 		 233 aa  92  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.73 
 
 		 281 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.42 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  32.22 
 
 		 334 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.73 
 
 		 285 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  30.05 
 
 		 322 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  31.11 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.11 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.11 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  30.63 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  30.36 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  28.25 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.23 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.75 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  28.25 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  28.25 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  28.25 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  28.25 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  28.25 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  28.25 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  28.89 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.91 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.04 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.04 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  28.96 
 
 		 243 aa  72  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  29.65 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  29 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  26.94 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  30.37 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  29.28 
 
 		 188 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1231  HAD family hydrolase  32.38 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.34 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.04 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.38 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.17 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  36.89 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0384  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.53 
 
 		 226 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000618634  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  24.87 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  32.67 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  32.67 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  28.38 
 
 		 1053 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  32.67 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  32.67 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.67 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  32.67 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.57 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42723  predicted protein  26.67 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  31.09 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  26 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28 
 
 		 222 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  27.45 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  21.69 
 
 		 229 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  35.37 
 
 		 196 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>