258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3139 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
325 aa  661    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  63.18 
 
 
297 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  59.46 
 
 
296 aa  332  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  62.5 
 
 
297 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  59.46 
 
 
297 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  58.59 
 
 
309 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  59.12 
 
 
297 aa  311  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  55.89 
 
 
298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  68.75 
 
 
226 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  55.74 
 
 
296 aa  296  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  57.58 
 
 
298 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  57.58 
 
 
299 aa  292  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  53.82 
 
 
295 aa  285  9e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  55.56 
 
 
299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  55.22 
 
 
299 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  54.08 
 
 
299 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  54.73 
 
 
296 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  54.39 
 
 
296 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  53.87 
 
 
298 aa  277  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  54.21 
 
 
298 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  52.51 
 
 
296 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  62.29 
 
 
241 aa  269  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  52.19 
 
 
298 aa  269  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  52.03 
 
 
295 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  54.08 
 
 
297 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  48.64 
 
 
291 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  58.05 
 
 
289 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  50.85 
 
 
291 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  49.83 
 
 
291 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  51.36 
 
 
292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  50.17 
 
 
291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  49.44 
 
 
291 aa  245  6.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  48.63 
 
 
292 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  49.43 
 
 
299 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  49.81 
 
 
291 aa  229  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  49.62 
 
 
294 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  49.82 
 
 
332 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  45.02 
 
 
298 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  46.98 
 
 
281 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  47.95 
 
 
435 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  43.32 
 
 
432 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  46.57 
 
 
302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  45.18 
 
 
429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  43.41 
 
 
419 aa  172  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  46.38 
 
 
325 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  40 
 
 
404 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  44.74 
 
 
297 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  46.38 
 
 
325 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  45.87 
 
 
404 aa  169  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  45.59 
 
 
275 aa  168  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  43.15 
 
 
403 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  45.29 
 
 
420 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  38.33 
 
 
410 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  42.15 
 
 
398 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  43.62 
 
 
406 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  45.41 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  39.82 
 
 
278 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  46.38 
 
 
325 aa  165  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  41.3 
 
 
276 aa  165  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  41.22 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  42.28 
 
 
419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  42.49 
 
 
411 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  44.65 
 
 
408 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  41.34 
 
 
296 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  43.04 
 
 
429 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  43.91 
 
 
404 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  44.81 
 
 
400 aa  162  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 
284 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  42.29 
 
 
410 aa  161  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  44.93 
 
 
325 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  45.12 
 
 
404 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  43.48 
 
 
429 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  39.42 
 
 
400 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  40.68 
 
 
412 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  43.17 
 
 
438 aa  159  8e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  43.89 
 
 
418 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  45.54 
 
 
279 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  44.04 
 
 
418 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  38.19 
 
 
404 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  46.5 
 
 
296 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  42.06 
 
 
326 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  47.89 
 
 
294 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  45.67 
 
 
241 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  43.75 
 
 
307 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  42.06 
 
 
326 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  42.06 
 
 
326 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  41.56 
 
 
407 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  44.33 
 
 
279 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  43.59 
 
 
404 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  44.06 
 
 
280 aa  155  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  39.92 
 
 
413 aa  155  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  45.59 
 
 
281 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  36.89 
 
 
415 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  43.69 
 
 
326 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  45.59 
 
 
316 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  45.59 
 
 
316 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  45.59 
 
 
281 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  44.39 
 
 
285 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  43.98 
 
 
235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  36.25 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>