183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3060 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  59.69 
 
 
574 aa  672    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  56.72 
 
 
575 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
590 aa  1191    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  52.14 
 
 
595 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  34.58 
 
 
567 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  34.58 
 
 
567 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  34.58 
 
 
567 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  34.56 
 
 
442 aa  246  6.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.81 
 
 
554 aa  204  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  30.45 
 
 
554 aa  196  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.41 
 
 
554 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  31.53 
 
 
556 aa  181  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  32.59 
 
 
550 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.88 
 
 
583 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.67 
 
 
585 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.12 
 
 
572 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  30.18 
 
 
607 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  30.09 
 
 
553 aa  165  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  34.32 
 
 
545 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.21 
 
 
596 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  26.21 
 
 
596 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.92 
 
 
567 aa  161  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  26.21 
 
 
596 aa  159  9e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.38 
 
 
586 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  27.84 
 
 
548 aa  157  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.47 
 
 
592 aa  155  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.8 
 
 
569 aa  150  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  27.82 
 
 
576 aa  148  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  25.63 
 
 
581 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  27.17 
 
 
576 aa  137  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  28.41 
 
 
558 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.47 
 
 
578 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.69 
 
 
692 aa  133  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.69 
 
 
561 aa  124  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  27.09 
 
 
508 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  24.49 
 
 
551 aa  103  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  24.49 
 
 
551 aa  103  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.24 
 
 
571 aa  102  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.42 
 
 
545 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.7 
 
 
747 aa  100  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  29.07 
 
 
595 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.31 
 
 
587 aa  94.7  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  22.72 
 
 
597 aa  94  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.53 
 
 
561 aa  93.2  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.19 
 
 
567 aa  93.6  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  28.37 
 
 
568 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  28.37 
 
 
568 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.18 
 
 
560 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.29 
 
 
554 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5786  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.9 
 
 
592 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.564372  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  25 
 
 
569 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.95 
 
 
559 aa  85.1  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  26.72 
 
 
569 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.61 
 
 
546 aa  83.2  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.94 
 
 
554 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  33.33 
 
 
692 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.51 
 
 
569 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.93 
 
 
585 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.49 
 
 
561 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  24.2 
 
 
588 aa  77.4  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  29.57 
 
 
561 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.57 
 
 
561 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.54 
 
 
549 aa  77  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.57 
 
 
561 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.42 
 
 
561 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  22.13 
 
 
584 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  23.76 
 
 
570 aa  75.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.62 
 
 
581 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.42 
 
 
561 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.62 
 
 
581 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  25.9 
 
 
557 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  28.49 
 
 
561 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.18 
 
 
573 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  26.43 
 
 
586 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.89 
 
 
568 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  23.34 
 
 
585 aa  74.3  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  26.43 
 
 
586 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  26.67 
 
 
555 aa  73.9  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  23.84 
 
 
565 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  27.78 
 
 
551 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  23.11 
 
 
568 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.91 
 
 
563 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.62 
 
 
558 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  29.17 
 
 
562 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  25.28 
 
 
599 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  29.17 
 
 
565 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.33 
 
 
580 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  27.22 
 
 
551 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  27.22 
 
 
551 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  27.22 
 
 
551 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  27.22 
 
 
551 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  27.22 
 
 
559 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  25.1 
 
 
574 aa  71.2  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  27.22 
 
 
559 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  30.16 
 
 
562 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  23.55 
 
 
558 aa  70.5  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.57 
 
 
570 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.39 
 
 
568 aa  68.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  29.63 
 
 
562 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  26.98 
 
 
564 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>