38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3038 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3038  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  188  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00723239  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1937  protein of unknown function DUF1153  90 
 
 
91 aa  170  6e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0692  hypothetical protein  88.89 
 
 
91 aa  163  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0600  hypothetical protein  88.89 
 
 
91 aa  163  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1271  hypothetical protein  88.89 
 
 
91 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0170267  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3847  hypothetical protein  88.89 
 
 
91 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0901905  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0940  hypothetical protein  88.89 
 
 
91 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539501  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4574  protein of unknown function DUF1153  86.67 
 
 
91 aa  162  1e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.914351  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2602  hypothetical protein  85.56 
 
 
91 aa  161  2e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4093  hypothetical protein  86.67 
 
 
91 aa  162  2e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1456  protein of unknown function DUF1153  87.78 
 
 
91 aa  161  2e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1593  hypothetical protein  85.56 
 
 
91 aa  161  2e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000171018  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4461  protein of unknown function DUF1153  86.67 
 
 
91 aa  162  2e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0864349  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1536  hypothetical protein  85.56 
 
 
91 aa  161  2e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5060  hypothetical protein  85.56 
 
 
91 aa  160  4e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.538696  normal  0.441334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3075  protein of unknown function DUF1153  85.56 
 
 
91 aa  160  4e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3332  protein of unknown function DUF1153  85.56 
 
 
91 aa  160  4e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.367393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5121  hypothetical protein  85.56 
 
 
91 aa  160  5e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0231345 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3524  hypothetical protein  84.44 
 
 
91 aa  160  5e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.471773  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1575  hypothetical protein  84.44 
 
 
91 aa  159  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6062  protein of unknown function DUF1153  84.44 
 
 
91 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1308  hypothetical protein  83.33 
 
 
91 aa  157  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201636  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2216  hypothetical protein  81.11 
 
 
91 aa  154  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0429129  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1017  hypothetical protein  76.67 
 
 
91 aa  150  8e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.448533  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2185  hypothetical protein  75.56 
 
 
91 aa  144  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0687  hypothetical protein  75.28 
 
 
89 aa  140  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.757409  normal  0.611658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1011  hypothetical protein  78.05 
 
 
93 aa  139  1e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312156  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0041  hypothetical protein  60 
 
 
99 aa  119  2e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2032  hypothetical protein  62.22 
 
 
101 aa  118  2e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4750  hypothetical protein  53.85 
 
 
99 aa  111  4e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.689478  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1507  hypothetical protein  54.43 
 
 
92 aa  91.3  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362913  normal  0.80475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2506  hypothetical protein  53.16 
 
 
93 aa  87  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0066  hypothetical protein  46.07 
 
 
94 aa  84  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1278  hypothetical protein  49.38 
 
 
92 aa  82.8  1e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.449026  normal  0.349266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2620  hypothetical protein  49.38 
 
 
92 aa  82.8  2e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7919  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1904  hypothetical protein  48.15 
 
 
92 aa  81.6  3e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.918743 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1400  hypothetical protein  49.41 
 
 
92 aa  79.3  2e-14  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4097  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  77  8e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>