111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3027 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3027  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 250 aa  498  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3841  DNA repair protein RecO  58.47 
 
 		 247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1181  DNA repair protein RecO  57.92 
 
 		 246 aa  275  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1051  DNA repair protein RecO  57.92 
 
 		 246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2028  DNA repair protein RecO  60.17 
 
 		 239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0991  DNA repair protein RecO  58.33 
 
 		 246 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0952  DNA repair protein RecO  55.1 
 
 		 248 aa  264  8e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0664  DNA repair protein RecO  53.75 
 
 		 247 aa  261  4.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0658  DNA repair protein RecO  53.75 
 
 		 247 aa  261  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.444158  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2625  DNA repair protein RecO  53.62 
 
 		 243 aa  258  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.535801  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2654  DNA repair protein RecO  53.04 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.113665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2643  DNA repair protein RecO  51.84 
 
 		 254 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0111364  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2615  DNA repair protein RecO  53.04 
 
 		 249 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2975  DNA repair protein RecO  51.61 
 
 		 250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1915  DNA repair protein RecO  53.11 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.385532  normal  0.463862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0693  DNA repair protein RecO  49 
 
 		 249 aa  242  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4316  DNA repair protein RecO  57.74 
 
 		 267 aa  242  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.382464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3340  DNA repair protein RecO  56.9 
 
 		 246 aa  242  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2248  DNA repair protein RecO  50.61 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0352637  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1155  DNA repair protein RecO  50.62 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4680  DNA repair protein RecO  48.78 
 
 		 248 aa  232  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0101452  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1003  DNA repair protein RecO  50 
 
 		 256 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.185486  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1452  DNA repair protein RecO  50.21 
 
 		 264 aa  229  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3886  DNA repair protein RecO  50.85 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0475  DNA repair protein RecO  48.28 
 
 		 245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1678  DNA repair protein RecO  49.79 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0311  DNA repair protein RecO  49.36 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2568  DNA repair protein RecO  46.78 
 
 		 237 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2876  DNA repair protein RecO  46.75 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379207 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1568  DNA repair protein RecO  42.17 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2556  DNA repair protein RecO  45.08 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  hitchhiker  0.0016899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0527  DNA repair protein RecO  43.88 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1740  DNA repair protein RecO  43.59 
 
 		 243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0935489  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0203  DNA repair protein RecO  41.35 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203836  normal  0.794392 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2837  DNA repair protein RecO  43.7 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1849  DNA repair protein RecO  39.83 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3349  DNA repair protein RecO  42.02 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.658048  normal  0.941393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4493  DNA repair protein RecO  40 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0536  DNA repair protein RecO  28.93 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0115625  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0219  DNA repair protein RecO  32.92 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0461  putative DNA repair protein RecO  35.79 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1209  DNA repair protein RecO  38.63 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0499  DNA repair protein RecO  30.8 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1084  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like protein  30.47 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  31.9 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002499  DNA recombination and repair protein RecO  32.08 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01719  DNA repair protein RecO  35.76 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.748158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  29.63 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1206  DNA repair protein RecO  30.06 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  35.48 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3667  DNA repair protein RecO  30.49 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2973  DNA repair protein RecO  32.68 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318586  hitchhiker  0.00228518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  30.82 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  30.49 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3069  DNA repair protein RecO  30.43 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2523  DNA repair protein RecO  26.74 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0679966  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2037  DNA repair protein RecO  31.06 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  28.12 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1138  DNA repair protein RecO  29.11 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.146606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3613  DNA repair protein RecO  29.11 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1191  DNA repair protein RecO  29.11 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  30.52 
 
 		 243 aa  52.4  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0995  DNA repair protein RecO  30.91 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2661  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)-like  32.47 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2241  DNA replication and repair protein RecO  30.14 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  28.02 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  29.61 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0032  DNA repair protein RecO  31.29 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0930  DNA repair protein RecO  35.71 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133285  normal  0.103629 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  26.16 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2783  DNA repair protein RecO  29.75 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03534  recombinational DNA repair protein  31.47 
 
 		 219 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1757  DNA repair protein RecO  30.11 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.108646  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  27.81 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54300  DNA repair protein RecO  31.1 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4747  DNA repair protein RecO  31.1 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0483  DNA repair protein  32.88 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1684  DNA repair protein RecO  32.88 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1070  DNA repair protein RecO  29.11 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0843  DNA repair protein RecO  33.56 
 
 		 336 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1065  DNA repair protein RecO  29.93 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0820208  normal  0.0227401 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  27.27 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0186  DNA repair protein RecO  22.84 
 
 		 232 aa  45.8  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.93882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1248  DNA repair protein RecO  26.39 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1087  DNA repair protein RecO  31.76 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  25.79 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  26.82 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2243  DNA repair protein RecO  25.93 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1377  DNA repair protein RecO  31.61 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2897  DNA repair protein RecO  31.76 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.64605  normal  0.158668 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  25.31 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1123  DNA repair protein RecO  27.51 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1402  DNA repair protein RecO, putative  27.51 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2893  DNA repair protein RecO  30.64 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2464  DNA repair protein RecO  30.06 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2817  DNA repair protein RecO  30.06 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2777  DNA repair protein RecO  30.06 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2838  DNA repair protein RecO  30.06 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1787  DNA repair protein RecO  30.06 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2957  DNA repair protein RecO  28.3 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>