More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3006 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010580  Bind_3830  transposase  99.04 
 
 
314 aa  637    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  100 
 
 
314 aa  645    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  85.67 
 
 
315 aa  569  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  65.4 
 
 
315 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  65.4 
 
 
315 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  65.4 
 
 
315 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  65.4 
 
 
315 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  65.4 
 
 
315 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  60.19 
 
 
315 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  57.83 
 
 
315 aa  361  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  57.83 
 
 
315 aa  361  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  57.83 
 
 
315 aa  361  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  57.83 
 
 
315 aa  361  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  56.83 
 
 
314 aa  342  5e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  49.52 
 
 
320 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3300  transposase  46.84 
 
 
318 aa  267  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477798  normal  0.920866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  67.21 
 
 
188 aa  266  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  46.67 
 
 
315 aa  258  9e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  46.67 
 
 
315 aa  258  9e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  65.57 
 
 
188 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  45.86 
 
 
315 aa  251  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  45.86 
 
 
315 aa  251  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  46.03 
 
 
314 aa  249  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  43.53 
 
 
319 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0954  ISRm2011-2 transposase protein  50.66 
 
 
238 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.901673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0976  ISRm2011-2 transposase protein  50.66 
 
 
238 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.425114  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1016  ISRm2011-2 transposase protein  50.66 
 
 
238 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  50.66 
 
 
238 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1999  ISRm2011-2 transposase protein  50.66 
 
 
238 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2260  ISRm2011-2 transposase protein  50.66 
 
 
238 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.252905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2411  ISRm2011-2 transposase protein  50.66 
 
 
238 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.125527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2437  ISRm2011-2 transposase protein  50.66 
 
 
238 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0646917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  50.66 
 
 
238 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  53.5 
 
 
213 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  53.5 
 
 
213 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  53.5 
 
 
213 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  53.5 
 
 
213 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  53.5 
 
 
213 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  53.5 
 
 
213 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  53.5 
 
 
213 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13540  transposase  52.45 
 
 
213 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  51.06 
 
 
283 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  53 
 
 
213 aa  226  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  62.65 
 
 
168 aa  225  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13570  transposase  53 
 
 
213 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45800  transposase  53 
 
 
213 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4691  hypothetical protein  39.24 
 
 
318 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3697  hypothetical protein  38.92 
 
 
318 aa  222  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3109  ISRm2011-2 transposase protein  58.01 
 
 
188 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2693  ISRm2011-2 transposase protein  58.01 
 
 
188 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1417  ISRm2011-2 transposase protein  58.56 
 
 
188 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154755  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2200  ISRm2011-2 transposase protein  57.46 
 
 
188 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.415704  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0578  hypothetical protein  38.92 
 
 
317 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0815  hypothetical protein  38.61 
 
 
317 aa  216  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2619  transposase  39.87 
 
 
319 aa  215  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.177595  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5181  putative transposase of insertion sequence  56.04 
 
 
191 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09550  transposase  54.59 
 
 
200 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303396  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0232  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
213 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268391  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0363  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
213 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.898022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0483  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
213 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0654  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
213 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0707  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
213 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0851  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
213 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0492095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1315  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
213 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1396  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
213 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.05552  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1968  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
213 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2029  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
213 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2060  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
213 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.322885  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2104  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
213 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2847  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
213 aa  206  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0803  putative ISRm2011-2 transposase protein  60.24 
 
 
169 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2949  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
213 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3008  ISRm2011-2 transposase protein  49.5 
 
 
213 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2370  ISRm2011-2 transposase protein  49 
 
 
213 aa  202  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299914  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36130  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  56.29 
 
 
169 aa  202  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3596  hypothetical protein  76.56 
 
 
132 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2108  transposase for insertion sequence element ISRM11/ISRM2011-2  48.5 
 
 
227 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1434  ISRm2011-2 transposase protein  59.74 
 
 
157 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0125  ISRm2011-2 transposase protein  59.74 
 
 
157 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1188  ISSpo6, transposase OrfB  56.55 
 
 
176 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1156  ISSpo6, transposase OrfB  56.55 
 
 
176 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.279659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3437  ISSpo6, transposase OrfB  56.55 
 
 
176 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4013  ISSpo6, transposase OrfB  56.55 
 
 
176 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3909  putative transposase of insertion sequence  56.02 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8444  putative transposase of insertion sequence  56.02 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5622  putative transposase of insertion sequence  56.02 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6255  putative transposase of insertion sequence  56.02 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8190  putative transposase of insertion sequence  56.02 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6103  putative transposase of insertion sequence  56.02 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6152  putative transposase of insertion sequence  56.02 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3455  putative transposase of insertion sequence  56.02 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3554  putative transposase of insertion sequence  56.02 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7501  putative transposase of insertion sequence  56.02 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.602331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0585  putative transposase of insertion sequence  56.02 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6428  putative transposase of insertion sequence  56.02 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6832  putative transposase of insertion sequence  56.02 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0631  putative transposase of insertion sequence  56.02 
 
 
173 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2489  ISRm2011-2 transposase protein  58.44 
 
 
157 aa  192  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.336252  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3597  transposase  79.31 
 
 
128 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3636  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  57.14 
 
 
158 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0772273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>