31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2975 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 298 aa  623  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  57.41 
 
 		 291 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  55.17 
 
 		 292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.86 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.45 
 
 		 287 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.52 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  31.06 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.06 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.06 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.64 
 
 		 315 aa  99  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.72 
 
 		 269 aa  96.3  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.99 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.52 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.04 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  30.3 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.35 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  30.37 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  27.56 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  25 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  27.08 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  23.24 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08106  conserved hypothetical protein  23.22 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386049 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  23.41 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.79 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  23.15 
 
 		 270 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  26.5 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.9 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2023  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.54 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.98 
 
 		 259 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  20.56 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>