150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2905 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  49.37 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  49.37 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  45.57 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  46.75 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  46.15 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  46.15 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  38.75 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  38.75 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  41.03 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  46.75 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  41.03 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  42.31 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  45.45 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  41.56 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  45.45 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  45.45 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  41.56 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  42.86 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  44.16 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  44.3 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  42.31 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  42.31 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  38.96 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  38.71 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  44.3 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  46.27 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  41.03 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  42.86 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  39.74 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  39.74 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  38.96 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  37.18 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  35.43 
 
 		 138 aa  62  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  41.56 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  39.36 
 
 		 112 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  43.28 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  40.51 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  38.96 
 
 		 332 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  37.66 
 
 		 390 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  37.18 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  37.18 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  39.53 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  38.46 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  38.81 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  41.03 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  37.5 
 
 		 275 aa  54.7  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  37.5 
 
 		 275 aa  54.7  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  35.9 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  36.14 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  36.84 
 
 		 137 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  37.33 
 
 		 140 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  37.33 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  33.33 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  29.71 
 
 		 413 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  35.8 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  39.74 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  36.84 
 
 		 137 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  32.14 
 
 		 265 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  38.46 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  36 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  39.24 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  34.62 
 
 		 259 aa  52.4  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  41.56 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  32.29 
 
 		 275 aa  52.4  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  37.35 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  32.69 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  29.69 
 
 		 134 aa  52.4  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  32.69 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  33.33 
 
 		 170 aa  52.4  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  33.33 
 
 		 170 aa  52.4  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  32.05 
 
 		 245 aa  51.6  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  36.84 
 
 		 121 aa  51.6  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  34.18 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  34.88 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  30.68 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  33.77 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  35.06 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  36.36 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  35.06 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  36.05 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  35.06 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  36.05 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  34.15 
 
 		 582 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  34.15 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0623  TonB family protein  38.75 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.480841  normal  0.103893 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  37.97 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  37.97 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  33.75 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  35.9 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  34.52 
 
 		 261 aa  48.5  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  32.89 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  29.21 
 
 		 267 aa  48.1  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3346  TonB family protein  33.77 
 
 		 283 aa  48.1  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.498939 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  35.9 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  34.67 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  33.72 
 
 		 391 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  43.55 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  30.85 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  43.55 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>