More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2866 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
322 aa  650    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  54.11 
 
 
319 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  53.16 
 
 
312 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  42.81 
 
 
312 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  42.04 
 
 
312 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  42.81 
 
 
312 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  45.78 
 
 
321 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  44.87 
 
 
310 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  40.89 
 
 
323 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  44.37 
 
 
310 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  43.55 
 
 
308 aa  225  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  41.99 
 
 
315 aa  225  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  41.61 
 
 
308 aa  218  7e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  41.94 
 
 
308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  41.94 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  43.59 
 
 
309 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  42.09 
 
 
323 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  42.44 
 
 
311 aa  207  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  41.48 
 
 
308 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  40.65 
 
 
306 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  39.55 
 
 
316 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  42.26 
 
 
306 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  41.29 
 
 
306 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  40.51 
 
 
308 aa  199  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  40.19 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  42.9 
 
 
310 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  41.29 
 
 
306 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  40.97 
 
 
306 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  40.65 
 
 
308 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  36.1 
 
 
315 aa  192  7e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  40.44 
 
 
322 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  38.85 
 
 
306 aa  186  5e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  38.61 
 
 
312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  38.51 
 
 
313 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  40.32 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  37.62 
 
 
307 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  37.26 
 
 
321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  39.37 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  37.34 
 
 
326 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  37.42 
 
 
320 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  37.62 
 
 
320 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  35.78 
 
 
306 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  36.91 
 
 
326 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  35.07 
 
 
315 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  36.93 
 
 
312 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  34.94 
 
 
329 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  32.92 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  33.65 
 
 
303 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  34.95 
 
 
317 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  35.81 
 
 
309 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  34.38 
 
 
313 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  34.38 
 
 
313 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  34.38 
 
 
313 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  34.47 
 
 
335 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  31.23 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  36.08 
 
 
316 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  35.17 
 
 
328 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  35.31 
 
 
306 aa  136  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  32.2 
 
 
315 aa  136  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  35.8 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  32.39 
 
 
319 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  32.06 
 
 
303 aa  132  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  33.76 
 
 
311 aa  132  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  31.89 
 
 
315 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  35.31 
 
 
336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  35.74 
 
 
332 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  30.56 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  32.08 
 
 
313 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  32.48 
 
 
346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  31.76 
 
 
313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  31.38 
 
 
316 aa  126  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  30.43 
 
 
323 aa  125  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  32.04 
 
 
338 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  31.25 
 
 
317 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  31 
 
 
332 aa  123  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  30.09 
 
 
319 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  30.75 
 
 
320 aa  122  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  33.95 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  30.15 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  30.09 
 
 
319 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  34.56 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  34.17 
 
 
300 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  33.66 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  29.85 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  30.43 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  30.28 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  29.47 
 
 
319 aa  116  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.49 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  28.53 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  28.53 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  32.26 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  29.87 
 
 
319 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  32.12 
 
 
322 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  27.73 
 
 
319 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  28.12 
 
 
304 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  31.86 
 
 
316 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  32.39 
 
 
306 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>