280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2806 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  100 
 
 
109 aa  213  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  85.06 
 
 
130 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  73.83 
 
 
110 aa  148  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  85.19 
 
 
125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  78.57 
 
 
108 aa  140  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  78.57 
 
 
108 aa  140  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  78.57 
 
 
108 aa  140  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  83.33 
 
 
131 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  63.37 
 
 
115 aa  123  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  70.11 
 
 
115 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  68.97 
 
 
106 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  56.99 
 
 
139 aa  114  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  58.23 
 
 
220 aa  100  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  63.38 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0343  flagellar motor switch protein FliN  53.16 
 
 
194 aa  94.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24486  normal  0.0165317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0248  flagellar motor switch protein FliN  56.25 
 
 
215 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00193923  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0311  flagellar motor switch protein FliN  51.9 
 
 
195 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  54.88 
 
 
125 aa  90.1  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  58.44 
 
 
115 aa  87.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  56.41 
 
 
117 aa  87  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  47 
 
 
115 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  53.16 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  47 
 
 
115 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  50.63 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  46 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  54.55 
 
 
110 aa  84  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  48.75 
 
 
188 aa  84  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  48.19 
 
 
135 aa  83.6  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  45.19 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  45.19 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  48.81 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  43.69 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  46.15 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  48.81 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  46.67 
 
 
411 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  44.21 
 
 
175 aa  82  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  45.56 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  50 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  54.55 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  47.73 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  47.73 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  47.5 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  54.55 
 
 
115 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  50 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  48.15 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  48.81 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  49.37 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  48.81 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  53.25 
 
 
116 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  48.81 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  46.91 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  47.62 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  50 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0688  flagellar motor switch protein  53.25 
 
 
116 aa  80.1  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0528144  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  50.63 
 
 
147 aa  80.1  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  49.38 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  44.57 
 
 
155 aa  80.1  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  51.25 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0596  flagellar motor switch protein  53.25 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  46.43 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  51.22 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  45 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  51.22 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  51.22 
 
 
97 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  45.24 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  45.24 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  48.75 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  43.69 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  45.68 
 
 
190 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  44.09 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  41.49 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  51.95 
 
 
116 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  50 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  47.5 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  51.95 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  43.75 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  48.72 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  48.72 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  48.72 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  48.72 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  48.72 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  48.72 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  48.72 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  48.72 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  46.91 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  48.15 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  47.78 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  48.72 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  46.99 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  44.44 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3292  flagellar motor switch protein FliN  43.62 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  46.24 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  51.32 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  46.99 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  44.44 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>