More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2792 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  100 
 
 
307 aa  613  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  67.25 
 
 
306 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  59.09 
 
 
302 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  57.69 
 
 
302 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  54.08 
 
 
306 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  55.71 
 
 
305 aa  326  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  53.74 
 
 
306 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  53.06 
 
 
306 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  53.68 
 
 
317 aa  315  8e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  56.25 
 
 
300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  54.33 
 
 
302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  56.21 
 
 
304 aa  308  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  49.84 
 
 
330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  54 
 
 
302 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  52.58 
 
 
324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  51.9 
 
 
320 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  52.19 
 
 
310 aa  305  6e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  51.48 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  52.05 
 
 
329 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  51.55 
 
 
324 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  50.17 
 
 
326 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  51.55 
 
 
305 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  48.62 
 
 
334 aa  282  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  51.53 
 
 
336 aa  276  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  52.61 
 
 
302 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  46.44 
 
 
304 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  47.8 
 
 
304 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  47.8 
 
 
304 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  43.9 
 
 
303 aa  243  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  43.9 
 
 
306 aa  242  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  44.66 
 
 
315 aa  235  9e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  42.81 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  45.45 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  45.42 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  45.58 
 
 
304 aa  229  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  41.41 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  41.84 
 
 
338 aa  215  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  38.89 
 
 
287 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  40.49 
 
 
301 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  39.72 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  41.34 
 
 
282 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  37.41 
 
 
274 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  38.46 
 
 
280 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  37.98 
 
 
290 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  39.37 
 
 
298 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  36.24 
 
 
290 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  36.46 
 
 
290 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  37.59 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  42.61 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  37.5 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  35.54 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  38.81 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  40.78 
 
 
282 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  40.48 
 
 
301 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  35.54 
 
 
290 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  34.6 
 
 
287 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  42.05 
 
 
282 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  41.13 
 
 
282 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  41.13 
 
 
282 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  40.07 
 
 
282 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  34.86 
 
 
290 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  40.07 
 
 
282 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  36.46 
 
 
289 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  40.48 
 
 
918 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  40.64 
 
 
282 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  36.62 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  39.72 
 
 
282 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  39.72 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  36.49 
 
 
289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  35.92 
 
 
281 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  40.21 
 
 
303 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  36.81 
 
 
289 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  40.07 
 
 
282 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  36.95 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  40.07 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  37.09 
 
 
302 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  36.61 
 
 
293 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  36.08 
 
 
287 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  34.15 
 
 
286 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  36.75 
 
 
302 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  36.48 
 
 
302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  38.08 
 
 
302 aa  155  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  35.33 
 
 
341 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  32.76 
 
 
286 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  32.53 
 
 
289 aa  152  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  36.59 
 
 
286 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  35.74 
 
 
285 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  34.62 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  30.25 
 
 
287 aa  146  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  32.79 
 
 
297 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  32.59 
 
 
326 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  32.73 
 
 
290 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  34.26 
 
 
299 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  32.65 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  35.83 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  36.15 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  33.78 
 
 
299 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  34.26 
 
 
277 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  29.02 
 
 
287 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  35.54 
 
 
337 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>