84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2759 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
437 aa  907    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  27.86 
 
 
442 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  27.86 
 
 
442 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  27.86 
 
 
442 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  27.86 
 
 
442 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  27.86 
 
 
442 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  27.86 
 
 
442 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  27.86 
 
 
442 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3846  hypothetical protein  26.56 
 
 
314 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  25.81 
 
 
450 aa  106  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  27.65 
 
 
450 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  27.65 
 
 
450 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  27.65 
 
 
450 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1195  hypothetical protein  24.24 
 
 
426 aa  96.3  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0627661  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  26.9 
 
 
891 aa  94  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  28.8 
 
 
873 aa  92.8  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  25.14 
 
 
442 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  27.22 
 
 
803 aa  87  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  25 
 
 
1276 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  29.95 
 
 
602 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  25.06 
 
 
437 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  24.93 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  22.8 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  27.13 
 
 
801 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  25.65 
 
 
534 aa  83.2  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4248  hypothetical protein  27.5 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0450926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  28.84 
 
 
604 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  24.04 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  25.72 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  23.94 
 
 
596 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3558  hypothetical protein  25.32 
 
 
482 aa  71.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  0.497656 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  25 
 
 
562 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  23.8 
 
 
564 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  24.79 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  23.03 
 
 
437 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  23.73 
 
 
597 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  28.85 
 
 
1086 aa  67  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  22.91 
 
 
614 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  24.85 
 
 
425 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  23.49 
 
 
448 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  24.92 
 
 
453 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  32.39 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  25 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  24.08 
 
 
436 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.39 
 
 
501 aa  57  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6094  hypothetical protein  28.47 
 
 
417 aa  57  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  21.01 
 
 
1141 aa  57  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  25.84 
 
 
468 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  24.93 
 
 
489 aa  56.6  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  22.91 
 
 
605 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  23.41 
 
 
596 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  29.27 
 
 
380 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  24.51 
 
 
578 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  23.33 
 
 
457 aa  53.9  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  22.55 
 
 
554 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  21.73 
 
 
544 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  22.84 
 
 
476 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0190  hypothetical protein  24.92 
 
 
427 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  22.18 
 
 
434 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  22.1 
 
 
601 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20600  glycoside hydrolase family 1  29.89 
 
 
424 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  26.42 
 
 
530 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3419  hypothetical protein  25.69 
 
 
472 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  31.17 
 
 
369 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  23.21 
 
 
446 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  21.81 
 
 
601 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  25 
 
 
508 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  24 
 
 
550 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.17 
 
 
611 aa  48.9  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  22.92 
 
 
447 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  31.11 
 
 
372 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.12 
 
 
514 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  21.82 
 
 
408 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  24.04 
 
 
455 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  32.03 
 
 
500 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  24.23 
 
 
326 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  24.24 
 
 
576 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  24.22 
 
 
584 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  25.17 
 
 
520 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 
477 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  31.13 
 
 
748 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  23.7 
 
 
550 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  23.38 
 
 
548 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  28.99 
 
 
542 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>