More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2693 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  532  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  60.77 
 
 
260 aa  330  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  58.43 
 
 
280 aa  311  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  59.02 
 
 
253 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  56.97 
 
 
283 aa  291  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  53.1 
 
 
268 aa  285  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  54 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  60 
 
 
274 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  53.6 
 
 
282 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  53.6 
 
 
277 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  55.81 
 
 
271 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  55.16 
 
 
274 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  55.25 
 
 
281 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  54.26 
 
 
279 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  54.26 
 
 
279 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  51 
 
 
281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  55.25 
 
 
281 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  54.86 
 
 
279 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  54.47 
 
 
279 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  54.47 
 
 
279 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  54.47 
 
 
279 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  53.7 
 
 
279 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  51.17 
 
 
271 aa  256  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  53.75 
 
 
244 aa  252  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  50.61 
 
 
271 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  48.41 
 
 
268 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  52.42 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  46.39 
 
 
301 aa  230  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  58.38 
 
 
326 aa  220  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  46.01 
 
 
301 aa  216  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  41.02 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  42.74 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  45.23 
 
 
298 aa  209  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  40.32 
 
 
286 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  43.04 
 
 
312 aa  193  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  40.08 
 
 
287 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  40.38 
 
 
274 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  37.16 
 
 
276 aa  168  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  38.34 
 
 
260 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  37.55 
 
 
256 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  38.33 
 
 
257 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  39.43 
 
 
257 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  40.85 
 
 
256 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  37.21 
 
 
282 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  35.8 
 
 
260 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  38.84 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  35.41 
 
 
260 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  37.45 
 
 
259 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  38.84 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  37.8 
 
 
264 aa  135  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  37.95 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  35.11 
 
 
263 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  35.27 
 
 
260 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  35.96 
 
 
263 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  38.57 
 
 
256 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  35.68 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0804  class II aldolase/adducin domain protein  36.52 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.864607  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  34.54 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  31.76 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  37.5 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  34.54 
 
 
331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0283  class II aldolase/adducin domain protein  33.48 
 
 
260 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.711177  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5443  class II aldolase/adducin domain protein  34.35 
 
 
260 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00180883  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4893  class II aldolase/adducin domain protein  34.35 
 
 
260 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0507067 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  38.57 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  36.32 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  37.9 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  34.02 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1161  class II aldolase/adducin domain protein  35.93 
 
 
260 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1007  class II aldolase/adducin domain protein  35.93 
 
 
260 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  36.32 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  38.63 
 
 
262 aa  125  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  34.8 
 
 
260 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  39.38 
 
 
262 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  33.48 
 
 
254 aa  125  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1000  class II aldolase/adducin domain protein  35.5 
 
 
260 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4614  class II aldolase/adducin domain protein  33.91 
 
 
260 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100188  hitchhiker  0.00381472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  40.29 
 
 
252 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  35.78 
 
 
252 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  36.24 
 
 
262 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  37.75 
 
 
261 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  37.78 
 
 
259 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  36.02 
 
 
255 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  37.07 
 
 
262 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  32.74 
 
 
260 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  34.32 
 
 
246 aa  123  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  32.64 
 
 
268 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  37.19 
 
 
262 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  39.81 
 
 
252 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0077  class II aldolase/adducin domain protein  33.48 
 
 
260 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0421444  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  36.02 
 
 
255 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  32.79 
 
 
251 aa  122  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  31.91 
 
 
263 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4108  class II aldolase/adducin domain protein  34.22 
 
 
258 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29216  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  33.74 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  36.84 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  32.81 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  33.63 
 
 
263 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  37.32 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  38.86 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>