More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2576 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  100 
 
 
475 aa  944    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1718  major facilitator transporter  57.75 
 
 
473 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442738  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  44.32 
 
 
477 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  43.07 
 
 
475 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  42.92 
 
 
472 aa  362  8e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  42.86 
 
 
475 aa  362  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  43.71 
 
 
472 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  43.71 
 
 
472 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  43.71 
 
 
472 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  42.07 
 
 
492 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  42.73 
 
 
472 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  42.36 
 
 
488 aa  350  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  42.89 
 
 
472 aa  349  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  43.46 
 
 
472 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  43.46 
 
 
472 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  43.46 
 
 
472 aa  349  6e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  43.46 
 
 
472 aa  349  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  43.24 
 
 
472 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.57 
 
 
487 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  41.97 
 
 
477 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  43.91 
 
 
469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  41.43 
 
 
494 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  42.46 
 
 
472 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  42.48 
 
 
472 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  41.4 
 
 
488 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  41.83 
 
 
479 aa  329  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  38.29 
 
 
479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  38.13 
 
 
479 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  39.78 
 
 
487 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  40.72 
 
 
472 aa  326  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  39.56 
 
 
487 aa  326  7e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 
472 aa  323  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  38.03 
 
 
482 aa  319  7e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 
479 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  39.79 
 
 
465 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  43.45 
 
 
471 aa  311  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  39.29 
 
 
479 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  43.22 
 
 
494 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  35.82 
 
 
471 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 
471 aa  290  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  35.19 
 
 
466 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
458 aa  207  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  30.15 
 
 
487 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  29.93 
 
 
485 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  29.71 
 
 
487 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  29.01 
 
 
485 aa  189  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  29.71 
 
 
487 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  29.28 
 
 
485 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  29.71 
 
 
487 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  31.86 
 
 
477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  30.55 
 
 
448 aa  184  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 
456 aa  179  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 
448 aa  177  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.24 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  30.84 
 
 
464 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.42 
 
 
461 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  29.13 
 
 
467 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 
473 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.81 
 
 
468 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.13 
 
 
470 aa  166  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  29.26 
 
 
459 aa  164  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
459 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
466 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  28.6 
 
 
462 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  28.48 
 
 
462 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  29.6 
 
 
474 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
459 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5934  major facilitator transporter  28.73 
 
 
468 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 
460 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.93 
 
 
474 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.81 
 
 
462 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.66 
 
 
468 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 
462 aa  150  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.22 
 
 
462 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
470 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
470 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  25.68 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 
444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 
451 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2060  inner membrane metabolite transport protein YdjE  27.25 
 
 
459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.78 
 
 
459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1999  major facilitator family transporter  27.86 
 
 
459 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0702699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1857  major facilitator transporter  27.86 
 
 
459 aa  131  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.526363  hitchhiker  0.0000247936 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  27.43 
 
 
474 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 
456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1860  major facilitator family transporter  27.65 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0174535  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5143  major facilitator transporter  27.27 
 
 
482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  27.1 
 
 
430 aa  128  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  28.37 
 
 
474 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
463 aa  126  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2499  major facilitator family transporter  27.65 
 
 
459 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465931  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  28.12 
 
 
474 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  26.79 
 
 
455 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01744  predicted transporter  28.23 
 
 
459 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955946  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01732  hypothetical protein  28.23 
 
 
459 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
450 aa  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  28.29 
 
 
474 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  27.64 
 
 
473 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1416  major facilitator family transporter  27.65 
 
 
459 aa  123  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.888006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>