105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2557 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  100 
 
 
188 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  82.58 
 
 
329 aa  274  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  83.23 
 
 
321 aa  273  1e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  82.58 
 
 
327 aa  273  2e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  82.58 
 
 
316 aa  272  2e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  82.58 
 
 
316 aa  272  2e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  82.58 
 
 
316 aa  272  2e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  82.58 
 
 
316 aa  272  2e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  82.58 
 
 
316 aa  272  2e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  82.58 
 
 
316 aa  272  2e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  81.94 
 
 
329 aa  272  2e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  82.58 
 
 
316 aa  272  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  81.94 
 
 
316 aa  270  8e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  77.42 
 
 
330 aa  249  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  77.42 
 
 
330 aa  249  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  77.42 
 
 
330 aa  249  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  77.42 
 
 
330 aa  249  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  76.77 
 
 
330 aa  247  6e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  76.77 
 
 
355 aa  245  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  76.77 
 
 
348 aa  245  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  73.75 
 
 
303 aa  243  2e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  72.26 
 
 
463 aa  241  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  72.9 
 
 
206 aa  240  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  72.9 
 
 
319 aa  239  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  72.9 
 
 
319 aa  239  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  72.9 
 
 
319 aa  239  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  72.9 
 
 
319 aa  239  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  69.68 
 
 
320 aa  238  5e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  70.97 
 
 
221 aa  237  6e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  71.61 
 
 
178 aa  232  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  63.46 
 
 
314 aa  216  1e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  62.82 
 
 
320 aa  212  3e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  63.46 
 
 
314 aa  206  1e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  2.79647e-10 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  61.54 
 
 
284 aa  206  2e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  60 
 
 
316 aa  192  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  60 
 
 
316 aa  192  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  60 
 
 
316 aa  192  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  60 
 
 
316 aa  192  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  60 
 
 
316 aa  192  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  60 
 
 
316 aa  192  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  80.37 
 
 
286 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  80.37 
 
 
329 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  50.85 
 
 
265 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  57.42 
 
 
321 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  68.97 
 
 
277 aa  177  5e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0142  integrase, catalytic region  76.24 
 
 
111 aa  171  6e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  57.69 
 
 
259 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  39.64 
 
 
329 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  39.75 
 
 
332 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  39.75 
 
 
343 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  40 
 
 
333 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  40 
 
 
321 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1603  transcriptional regulator, putative  41.22 
 
 
302 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  40 
 
 
321 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  38.71 
 
 
463 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2732  transcriptional regulator, putative  41.09 
 
 
289 aa  91.7  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2839  transcriptional regulator, putative  41.09 
 
 
289 aa  91.7  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2665  transcriptional regulator, putative  41.09 
 
 
289 aa  91.3  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  34.34 
 
 
274 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1327  transcriptional regulator, putative  39.69 
 
 
289 aa  89.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  40.76 
 
 
323 aa  89.4  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  42.14 
 
 
325 aa  88.6  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  8.45152e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  42.14 
 
 
325 aa  88.2  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3201  transcriptional regulator, putative  37.14 
 
 
288 aa  87.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2906  transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 
288 aa  87.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2664  transcriptional regulator, putative  35.66 
 
 
284 aa  84  1e-15  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  37.04 
 
 
323 aa  83.2  2e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  37.04 
 
 
323 aa  83.6  2e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  31.93 
 
 
323 aa  83.6  2e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  34.18 
 
 
325 aa  82.4  3e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1424  transcriptional regulator, putative  36.72 
 
 
288 aa  82.4  3e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  39.26 
 
 
179 aa  82.8  3e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  34.18 
 
 
329 aa  82  4e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  34.18 
 
 
325 aa  82.4  4e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  34.18 
 
 
325 aa  82  4e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  34.18 
 
 
333 aa  82  4e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  34.18 
 
 
327 aa  82  4e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  34.18 
 
 
325 aa  82  4e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  34.18 
 
 
441 aa  82  5e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  34.18 
 
 
497 aa  82  5e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  37.04 
 
 
323 aa  81.6  7e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2928  transcriptional regulator, putative  36.72 
 
 
289 aa  80.1  2e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  38.85 
 
 
216 aa  79.7  2e-14  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1420  transcriptional regulator, putative  36.72 
 
 
289 aa  80.1  2e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1454  transcriptional regulator, putative  36.72 
 
 
289 aa  80.1  2e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0697104  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1426  transcriptional regulator, putative  36.72 
 
 
289 aa  80.1  2e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  38.85 
 
 
216 aa  79.7  2e-14  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  31.25 
 
 
157 aa  79.3  3e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1222  transcriptional regulator, putative  35.38 
 
 
293 aa  78.2  6e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2626  transcriptional regulator, putative  34.72 
 
 
336 aa  77.8  1e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1116  transcriptional regulator, putative  40 
 
 
272 aa  76.3  2e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  50 
 
 
185 aa  76.3  3e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0371  hypothetical protein  68.75 
 
 
83 aa  68.9  4e-11  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.650544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  29.59 
 
 
330 aa  68.9  4e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1683  hypothetical protein  40.35 
 
 
275 aa  65.5  5e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0143  hypothetical protein  76.19 
 
 
42 aa  65.1  6e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4700  integrase, catalytic region  54.24 
 
 
65 aa  62.8  3e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3105  hypothetical protein  36.21 
 
 
290 aa  60.1  2e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1518  hypothetical protein  38.54 
 
 
101 aa  57.4  1e-07  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2980  hypothetical protein  35.58 
 
 
274 aa  57  2e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653613  normal  0.40333 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>