More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2391 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2391  NADH dehydrogenase subunit H  100 
 
 
342 aa  674  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  4.91536e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2925  NADH dehydrogenase subunit H  85.67 
 
 
342 aa  567  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  80.24 
 
 
340 aa  529  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  79.94 
 
 
340 aa  524  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.425523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  79.94 
 
 
340 aa  524  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  79.64 
 
 
340 aa  521  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4133  NADH dehydrogenase subunit H  78.51 
 
 
340 aa  515  1e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4626  NADH dehydrogenase subunit H  79.38 
 
 
339 aa  512  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0842951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4397  NADH dehydrogenase subunit H  78.81 
 
 
340 aa  511  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2581  NADH dehydrogenase subunit H  74.92 
 
 
341 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1360  NADH dehydrogenase subunit H  76.02 
 
 
347 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0549439  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1268  NADH dehydrogenase subunit H  74.85 
 
 
347 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.279404  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2878  NADH dehydrogenase subunit H  74.92 
 
 
341 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.171106 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0897  NADH dehydrogenase subunit H  75.44 
 
 
347 aa  491  1e-138  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4554  NADH dehydrogenase subunit H  73.68 
 
 
356 aa  488  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1029  NADH dehydrogenase subunit H  75 
 
 
347 aa  488  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182867  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  74.27 
 
 
347 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1880  NADH dehydrogenase subunit H  72.51 
 
 
356 aa  486  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.517536  normal  0.265736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2411  NADH dehydrogenase subunit H  75.9 
 
 
341 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3291  NADH dehydrogenase subunit H  76.15 
 
 
341 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0809  NADH dehydrogenase subunit H  73.82 
 
 
347 aa  478  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519776  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2416  NADH dehydrogenase subunit H  74.71 
 
 
347 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792289  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0804  NADH dehydrogenase subunit H  73.53 
 
 
347 aa  476  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0785  NADH dehydrogenase subunit H  72.06 
 
 
348 aa  468  1e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.181346  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2213  NADH dehydrogenase subunit H  71.68 
 
 
356 aa  469  1e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0909649  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3219  NADH dehydrogenase subunit H  74.47 
 
 
337 aa  461  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1321  NADH dehydrogenase subunit H  65.41 
 
 
345 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.967577  normal  0.0180993 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1998  NADH dehydrogenase subunit H  62.58 
 
 
345 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.222188  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2239  NADH dehydrogenase subunit H  62.27 
 
 
345 aa  398  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1185  NADH dehydrogenase subunit H  66.56 
 
 
346 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317431  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  63.26 
 
 
338 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1184  NADH dehydrogenase subunit H  62.58 
 
 
341 aa  384  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.503975  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2522  NADH dehydrogenase subunit H  62.58 
 
 
345 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0753  NADH dehydrogenase subunit H  61.32 
 
 
345 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112017  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  61.76 
 
 
341 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  57.59 
 
 
337 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1302  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  58.75 
 
 
347 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656687  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1362  NADH dehydrogenase subunit H  61.63 
 
 
356 aa  362  6e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.1215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2293  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  59.06 
 
 
347 aa  357  1e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2826  NADH dehydrogenase subunit H  62.5 
 
 
357 aa  353  3e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.276364  normal  0.0731875 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  54.3 
 
 
369 aa  344  1e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  57.31 
 
 
348 aa  344  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  54.65 
 
 
367 aa  342  4e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  54.19 
 
 
341 aa  340  3e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  52.83 
 
 
352 aa  330  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  51.27 
 
 
349 aa  328  6e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.61 
 
 
347 aa  328  8e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  48.16 
 
 
354 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  48.16 
 
 
354 aa  326  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  50 
 
 
354 aa  325  7e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  52.1 
 
 
366 aa  325  8e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  47.24 
 
 
354 aa  324  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  52.81 
 
 
340 aa  322  6e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1500  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.64 
 
 
360 aa  322  8e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  50 
 
 
340 aa  320  2e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  50 
 
 
340 aa  320  2e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.9 
 
 
344 aa  320  2e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  52.5 
 
 
340 aa  319  4e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  51.72 
 
 
343 aa  319  5e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  49.69 
 
 
352 aa  316  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.29 
 
 
360 aa  317  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  49.39 
 
 
359 aa  315  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  49.69 
 
 
354 aa  315  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  49.69 
 
 
352 aa  314  1e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  49.69 
 
 
354 aa  315  1e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  49.69 
 
 
354 aa  315  1e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.31 
 
 
349 aa  314  1e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  49.69 
 
 
354 aa  315  1e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  49.69 
 
 
352 aa  314  1e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  49.69 
 
 
352 aa  314  1e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  50.31 
 
 
333 aa  313  2e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  46.91 
 
 
354 aa  312  5e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  49.39 
 
 
358 aa  311  7e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.91 
 
 
339 aa  311  8e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.18 
 
 
357 aa  311  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  48.64 
 
 
341 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  48.64 
 
 
341 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  1.33524e-05 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  48.18 
 
 
357 aa  309  4e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  49.68 
 
 
354 aa  309  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  47.22 
 
 
354 aa  308  7e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  50.32 
 
 
355 aa  308  1e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  50.32 
 
 
355 aa  308  1e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  50.62 
 
 
336 aa  308  1e-82  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  48.19 
 
 
343 aa  306  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  47.34 
 
 
358 aa  306  4e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  49.68 
 
 
355 aa  305  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  48.42 
 
 
354 aa  305  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  50 
 
 
355 aa  305  8e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.59 
 
 
358 aa  305  1e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2002  NADH dehydrogenase subunit H  49.37 
 
 
354 aa  304  1e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.4994  normal  0.0583966 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.55 
 
 
358 aa  302  6e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0247  NADH dehydrogenase subunit H  47.71 
 
 
363 aa  299  4e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  50.5 
 
 
355 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  50.5 
 
 
355 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  50.5 
 
 
355 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0276  NADH dehydrogenase subunit H  47.71 
 
 
363 aa  298  9e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.32 
 
 
339 aa  297  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2824  NADH dehydrogenase subunit H  46.32 
 
 
364 aa  296  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00869776  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  47.55 
 
 
358 aa  296  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  47.46 
 
 
354 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>