166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2189 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  100 
 
 
250 aa  514  1e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  62.01 
 
 
285 aa  286  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  39.51 
 
 
327 aa  172  4e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  39.51 
 
 
328 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  42.27 
 
 
276 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  39.27 
 
 
270 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  38.91 
 
 
288 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  37.1 
 
 
289 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.75 
 
 
329 aa  113  2e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.95 
 
 
327 aa  112  7e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  34.33 
 
 
275 aa  111  1e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  34.33 
 
 
286 aa  111  1e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  30.73 
 
 
269 aa  110  2e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  32.21 
 
 
275 aa  109  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  35.41 
 
 
327 aa  108  7e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.12 
 
 
303 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  33.49 
 
 
277 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  33.66 
 
 
322 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  34.93 
 
 
379 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  34.08 
 
 
318 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  32.7 
 
 
279 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  31.58 
 
 
267 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  31.1 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  31.1 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  30.54 
 
 
238 aa  89  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  29.94 
 
 
252 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  27.83 
 
 
221 aa  81.3  1e-14  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  31.64 
 
 
253 aa  80.5  3e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  30.6 
 
 
259 aa  79.7  4e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  31.28 
 
 
259 aa  77  2e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  29.29 
 
 
253 aa  76.6  3e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3748  GDSL family lipase  31.86 
 
 
300 aa  75.1  1e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  29.67 
 
 
254 aa  73.6  3e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  30.46 
 
 
204 aa  70.1  3e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  27.36 
 
 
203 aa  68.2  1e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  37.07 
 
 
266 aa  67.4  2e-10  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  34.07 
 
 
270 aa  64.3  2e-09  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.33 
 
 
270 aa  63.9  2e-09  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  31.85 
 
 
213 aa  62.8  5e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  32.67 
 
 
259 aa  61.6  1e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  25.65 
 
 
252 aa  61.2  2e-08  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  27.89 
 
 
219 aa  59.7  4e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  27.23 
 
 
213 aa  58.9  7e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  25.98 
 
 
206 aa  58.2  1e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  28.07 
 
 
201 aa  57.8  2e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  1.00136e-10 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  25.49 
 
 
218 aa  57.4  2e-07  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  33.59 
 
 
203 aa  57  3e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  26.26 
 
 
239 aa  56.6  3e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  29.32 
 
 
201 aa  57  3e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  5.55437e-06  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  25.13 
 
 
223 aa  56.2  4e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  25.73 
 
 
205 aa  56.2  5e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  28.64 
 
 
242 aa  56.2  5e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.66 
 
 
198 aa  55.8  6e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  27.12 
 
 
202 aa  55.5  7e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  9.38694e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  25 
 
 
201 aa  55.5  8e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  28.28 
 
 
189 aa  54.7  1e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.57795e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  24.19 
 
 
210 aa  55.1  1e-06  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  30.89 
 
 
209 aa  54.7  1e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  26.29 
 
 
223 aa  53.9  2e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  28.83 
 
 
255 aa  54.3  2e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  28 
 
 
204 aa  53.9  2e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  25.97 
 
 
216 aa  54.7  2e-06  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  7.89426e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.7 
 
 
201 aa  53.5  3e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.6 
 
 
211 aa  52.8  5e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  28.89 
 
 
195 aa  52.8  6e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  23.08 
 
 
225 aa  52.4  6e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  27.56 
 
 
214 aa  52  8e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  29.84 
 
 
201 aa  52  9e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  29.6 
 
 
202 aa  52  9e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  24.75 
 
 
241 aa  51.6  1e-05  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  27.5 
 
 
216 aa  51.6  1e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  24.61 
 
 
195 aa  51.6  1e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28 
 
 
227 aa  51.6  1e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  28.57 
 
 
199 aa  51.6  1e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  3.20229e-06  hitchhiker  1.1785e-13 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  24.75 
 
 
241 aa  51.6  1e-05  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  30 
 
 
251 aa  50.8  2e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  24.49 
 
 
207 aa  50.4  2e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  26.35 
 
 
203 aa  50.8  2e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  30 
 
 
240 aa  51.2  2e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  24.06 
 
 
201 aa  51.2  2e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  28.47 
 
 
202 aa  51.2  2e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  28.57 
 
 
201 aa  50.4  3e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  23.86 
 
 
200 aa  50.4  3e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  25.53 
 
 
216 aa  50.4  3e-05  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  32.63 
 
 
224 aa  50.1  3e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4411  lipolytic protein G-D-S-L family  25 
 
 
228 aa  50.4  3e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  27.56 
 
 
210 aa  50.4  3e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  33.68 
 
 
208 aa  50.4  3e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  28.15 
 
 
201 aa  49.7  4e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  29.51 
 
 
205 aa  50.1  4e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  1.7765e-05 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  28.17 
 
 
214 aa  49.7  4e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0725  lipolytic protein G-D-S-L family  25.54 
 
 
266 aa  50.1  4e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.18 
 
 
227 aa  49.7  4e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  27.07 
 
 
201 aa  49.7  4e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  3.64152e-05 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  25.27 
 
 
226 aa  49.7  4e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  29.37 
 
 
248 aa  49.7  5e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  27.07 
 
 
201 aa  49.3  5e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  23.86 
 
 
200 aa  49.3  6e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  30.07 
 
 
240 aa  49.3  6e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  27.07 
 
 
201 aa  48.9  7e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  2.15675e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>