More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2116 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2116  pirin domain-containing protein  100 
 
 
297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0157857  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  64.97 
 
 
296 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0818  pirin domain-containing protein  63.12 
 
 
296 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5556  Pirin domain protein  50.99 
 
 
304 aa  315  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.856561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2359  Pirin domain protein  51.53 
 
 
306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.355023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  52.96 
 
 
296 aa  296  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  51.69 
 
 
312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  51.35 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  51.18 
 
 
312 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  50.69 
 
 
305 aa  281  9e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  50.34 
 
 
305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  50.17 
 
 
309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  50.17 
 
 
305 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  50 
 
 
306 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  47.96 
 
 
314 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  49.31 
 
 
306 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  46.98 
 
 
318 aa  268  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  49.31 
 
 
305 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  48.25 
 
 
304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  48.97 
 
 
307 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  47.08 
 
 
291 aa  265  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  46.94 
 
 
311 aa  265  8.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  49.31 
 
 
305 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  48.97 
 
 
305 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  47.78 
 
 
310 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  46.78 
 
 
313 aa  262  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  48.28 
 
 
307 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  48.1 
 
 
291 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  45.8 
 
 
291 aa  260  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  45.17 
 
 
290 aa  259  4e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  48.62 
 
 
307 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  46.42 
 
 
311 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  45.36 
 
 
296 aa  257  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  47.06 
 
 
291 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  45.83 
 
 
291 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0252  Pirin domain protein  45.86 
 
 
289 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.175941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0233  Pirin domain protein  45.52 
 
 
289 aa  255  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  46.76 
 
 
311 aa  254  9e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  47.06 
 
 
293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3696  Pirin domain protein  43.75 
 
 
300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.01108  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3781  Pirin-like  43.77 
 
 
294 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.871122 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  45.49 
 
 
289 aa  252  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  45.64 
 
 
306 aa  252  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  45.08 
 
 
312 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  44.56 
 
 
287 aa  249  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  47.06 
 
 
294 aa  248  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  45.49 
 
 
340 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  46.37 
 
 
306 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  45.67 
 
 
293 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  44.64 
 
 
307 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  43.45 
 
 
293 aa  246  4.9999999999999997e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  45.33 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  45.49 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  45.67 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  45.33 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  45.33 
 
 
290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  45.33 
 
 
293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  44.64 
 
 
307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  48.75 
 
 
307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  45.33 
 
 
293 aa  242  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  45.14 
 
 
307 aa  241  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1634  pirin domain-containing protein  45.92 
 
 
310 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  44.37 
 
 
294 aa  238  6.999999999999999e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1102  pirin domain-containing protein  44.77 
 
 
274 aa  238  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.596816  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  45.52 
 
 
294 aa  235  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  44.29 
 
 
306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  44.78 
 
 
293 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  46.02 
 
 
304 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  45.19 
 
 
294 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  44.78 
 
 
293 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  44.78 
 
 
293 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0362  hypothetical protein  46.05 
 
 
293 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0654105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  45.52 
 
 
294 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0662  hypothetical protein  46.05 
 
 
293 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.276579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0111  hypothetical protein  46.05 
 
 
293 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.335192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2498  hypothetical protein  46.05 
 
 
293 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.149095  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0907  pirin domain-containing protein  46.05 
 
 
293 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0904  pirin domain-containing protein  45.33 
 
 
293 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5228  pirin domain-containing protein  44.67 
 
 
298 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739076  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  44.07 
 
 
297 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  41.4 
 
 
296 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3748  pirin domain-containing protein  41.79 
 
 
287 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  43.32 
 
 
301 aa  209  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  43.32 
 
 
301 aa  208  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4177  Pirin domain protein  41.26 
 
 
293 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.630171  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3500  pirin domain-containing protein  40.89 
 
 
287 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.324071  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0588  putative pirin-like protein  43.24 
 
 
299 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.927348  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1691  pirin domain-containing protein  41.26 
 
 
287 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3027  pirin domain-containing protein  45.61 
 
 
316 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1627  Pirin-like  39.03 
 
 
296 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2485  pirin domain-containing protein  37.08 
 
 
286 aa  191  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.110651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2988  Pirin-related protein  42.41 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0421  pirin domain-containing protein  44.27 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  36.73 
 
 
332 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  36.39 
 
 
315 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2835  pirin domain-containing protein  36.96 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  38.93 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0050  Pirin-like protein  37.24 
 
 
301 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3541  pirin-like protein  35.07 
 
 
297 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4301  pirin domain-containing protein  33.45 
 
 
307 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.411445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>