137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2114 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2114  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  769    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000213217  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0167  hypothetical protein  73.95 
 
 
380 aa  591  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0469  protein of unknown function DUF214  51.3 
 
 
386 aa  417  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  46.47 
 
 
366 aa  342  9e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  42.33 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  39.22 
 
 
382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  36.13 
 
 
378 aa  239  8e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  35.68 
 
 
378 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  36.46 
 
 
378 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0146  ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 
378 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1317  efflux ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 
378 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2626  efflux ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 
378 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0172  efflux ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 
378 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.776599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1034  ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 
378 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.778603  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  35.53 
 
 
378 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1222  hypothetical protein  34.92 
 
 
398 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  36.5 
 
 
378 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4558  protein of unknown function DUF214  35.57 
 
 
378 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.987497  normal  0.0915843 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5886  hypothetical protein  35.42 
 
 
378 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4425  protein of unknown function DUF214  35.57 
 
 
378 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.144574  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1293  hypothetical protein  34.97 
 
 
384 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  33.6 
 
 
378 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  33.6 
 
 
378 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  31.88 
 
 
380 aa  189  9e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1398  protein of unknown function DUF214  34.46 
 
 
397 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00210458  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  31.11 
 
 
380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  29.89 
 
 
376 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  30 
 
 
410 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 
376 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.06 
 
 
375 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3894  hypothetical protein  26.12 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  26.77 
 
 
376 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  26.46 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  26.09 
 
 
407 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  27.84 
 
 
372 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  25.89 
 
 
388 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  25.39 
 
 
377 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  25.38 
 
 
388 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  23.93 
 
 
415 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  25 
 
 
395 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  22.89 
 
 
392 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  23.47 
 
 
397 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0009  DevC protein  25.64 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  23.04 
 
 
392 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3709  protein of unknown function DUF214  25.72 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0331  DevC protein  22.72 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  22.31 
 
 
383 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  23.72 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  21.72 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  23.99 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  22.05 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4445  DevC protein  22.51 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  23.68 
 
 
385 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0126  hypothetical protein  21.55 
 
 
384 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447116  normal  0.743413 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  22.05 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1218  DevC protein  22.75 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.188524  normal  0.730906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2586  DevC protein  21.16 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.131635  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16601  ABC-transporter, membrane spanning component  23.02 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.513807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1233  DevC protein  23.54 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000657909  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07851  ABC-transporter, membrane spanning component  23.51 
 
 
391 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.165508  normal  0.803737 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0153  ABC transporter transmembrane protein  23.51 
 
 
391 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10141  ABC-transporter, membrane spanning component  23.68 
 
 
390 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8535  normal  0.0327944 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  20.25 
 
 
392 aa  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0757  ABC transporter transmembrane protein  21.28 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.750458  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  25.26 
 
 
380 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1251  DevC protein  22.34 
 
 
389 aa  59.7  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0933437  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08091  ABC-transporter, membrane spanning component  21.61 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.270503  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08351  ABC-transporter, membrane spanning component  21.32 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08101  ABC-transporter, membrane spanning component  21.2 
 
 
390 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2783  ABC transporter, membrane spanning subunit, devC-like  21.9 
 
 
393 aa  53.9  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301274  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1408  protein of unknown function DUF214  22.14 
 
 
379 aa  53.9  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485745  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  24.23 
 
 
349 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  24.23 
 
 
349 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.17 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1336  hypothetical protein  24.79 
 
 
454 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.420659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  21.81 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  31.2 
 
 
349 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  22.41 
 
 
400 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18550  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  32.77 
 
 
383 aa  50.8  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.766854  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  21.69 
 
 
422 aa  50.8  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.65 
 
 
408 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  22.37 
 
 
377 aa  49.7  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 
871 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  23.45 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  20.96 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  30.97 
 
 
401 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  30.97 
 
 
401 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  30.97 
 
 
401 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0889  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.69 
 
 
411 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  30.97 
 
 
401 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  24.38 
 
 
407 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.78 
 
 
418 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  32.74 
 
 
401 aa  47  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  32.73 
 
 
401 aa  47  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  23.9 
 
 
399 aa  46.2  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1432  hypothetical protein  23.58 
 
 
402 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.696316  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3560  protein of unknown function DUF214  26.02 
 
 
405 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  25 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>