More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2107 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
148 aa  289  7e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  92.13 
 
 
145 aa  236  8e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  85.25 
 
 
140 aa  214  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  79.39 
 
 
131 aa  202  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  82.35 
 
 
134 aa  201  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  82.35 
 
 
134 aa  201  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  72.22 
 
 
177 aa  201  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  73.61 
 
 
184 aa  200  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  83.76 
 
 
130 aa  199  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  72.92 
 
 
183 aa  199  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  79.2 
 
 
131 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  75.37 
 
 
132 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  70.14 
 
 
180 aa  197  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  75.57 
 
 
131 aa  196  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  75.57 
 
 
131 aa  196  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  79.67 
 
 
126 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  79.67 
 
 
126 aa  194  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  76.19 
 
 
129 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  74.81 
 
 
131 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  77.24 
 
 
127 aa  192  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 
166 aa  187  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 
132 aa  184  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  75 
 
 
131 aa  183  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  74.36 
 
 
130 aa  181  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  76.72 
 
 
145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  76.72 
 
 
145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  76.92 
 
 
146 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  68.99 
 
 
129 aa  179  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  75.86 
 
 
145 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  61.97 
 
 
163 aa  173  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2150  50S ribosomal protein L19  68.97 
 
 
124 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  70.09 
 
 
125 aa  168  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3279  50S ribosomal protein L19  68.25 
 
 
126 aa  166  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0341  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 
124 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164171  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0742  50S ribosomal protein L19  66.14 
 
 
127 aa  160  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  65.38 
 
 
128 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0878  50S ribosomal protein L19  63.28 
 
 
128 aa  156  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.714575  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0936  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 
128 aa  156  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0118366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0807  50S ribosomal protein L19  63.28 
 
 
128 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410607  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  64.29 
 
 
126 aa  154  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 
115 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2537  50S ribosomal protein L19  67.72 
 
 
127 aa  153  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155158  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3352  50S ribosomal protein L19  64.29 
 
 
127 aa  153  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459545  normal  0.21243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2700  50S ribosomal protein L19  64.29 
 
 
127 aa  153  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0395  50S ribosomal protein L19  63.56 
 
 
114 aa  153  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2974  50S ribosomal protein L19  62.79 
 
 
129 aa  153  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185414  normal  0.0681768 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1009  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 
128 aa  153  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359648  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1476  ribosomal protein L19  64.12 
 
 
127 aa  152  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 
116 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2231  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 
130 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133079  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 
116 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0400  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 
129 aa  151  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311266  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 
126 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2965  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 
129 aa  151  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0916  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 
129 aa  151  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1664  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 
129 aa  151  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1107  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 
117 aa  151  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2856  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 
129 aa  151  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878575  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2916  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 
129 aa  151  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  60 
 
 
118 aa  152  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0231  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 
129 aa  151  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 
116 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2542  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 
129 aa  151  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0263241  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0827  50S ribosomal protein L19  66.95 
 
 
128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  62.39 
 
 
115 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 
118 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4154  50S ribosomal protein L19  65.52 
 
 
116 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39530  50S ribosomal protein L19  67.24 
 
 
116 aa  150  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0334012  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0348  ribosomal protein L19  60.83 
 
 
121 aa  150  5e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2784  50S ribosomal protein L19  62.18 
 
 
135 aa  150  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0887  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 
117 aa  150  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00504476  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1024  50S ribosomal protein L19  59.17 
 
 
121 aa  149  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.688153  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  64.96 
 
 
115 aa  149  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1693  50S ribosomal protein L19  62.6 
 
 
121 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1464  50S ribosomal protein L19  60.63 
 
 
130 aa  149  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0772  50S ribosomal protein L19  65.25 
 
 
127 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3884  50S ribosomal protein L19  73.28 
 
 
126 aa  149  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0241892  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  60.68 
 
 
118 aa  148  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0952  50S ribosomal protein L19  62.7 
 
 
130 aa  148  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381908  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4186  50S ribosomal protein L19  62.7 
 
 
130 aa  148  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.105391  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 
113 aa  148  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1031  50S ribosomal protein L19  62.31 
 
 
130 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0593  50S ribosomal protein L19  62.31 
 
 
130 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095314  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1072  50S ribosomal protein L19  62.31 
 
 
130 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  64.17 
 
 
146 aa  148  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0751  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 
130 aa  147  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0948  50S ribosomal protein L19  62.7 
 
 
130 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.757688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 
116 aa  147  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  58.54 
 
 
119 aa  147  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0684  50S ribosomal protein L19  64.41 
 
 
117 aa  147  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  63.56 
 
 
114 aa  147  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  63.56 
 
 
114 aa  147  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  64.96 
 
 
115 aa  146  9e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  64.96 
 
 
115 aa  146  9e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1022  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 
116 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  64.66 
 
 
117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 
117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2277  50S ribosomal protein L19  64.1 
 
 
118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122186  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2003  ribosomal protein L19  66.38 
 
 
115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000253757  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  61.54 
 
 
115 aa  144  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>