More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2079 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2079  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 249 aa  501  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.744782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4324  GntR domain-containing protein  55.17 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133049 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5710  GntR domain protein  47.77 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5340  GntR domain protein  46.64 
 
 		 241 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0345729 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  44.84 
 
 		 379 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  30.73 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  27.67 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.94 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  27.88 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  27.27 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  28.81 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  27.27 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  27.27 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  27.27 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  28.81 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  27.27 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  28.81 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  27.27 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  28.81 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  27.27 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  27.27 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  28.81 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  26.94 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  30.73 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  27.91 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  27.16 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  28.24 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3837  transcriptional regulator NanR  27.93 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  27.59 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  25.11 
 
 		 234 aa  87  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  27.88 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  28.1 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  28.25 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  28.57 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  30.88 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  31.88 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  27.73 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  30.04 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3102  GntR domain-containing protein  30.37 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4074  GntR domain-containing protein  30.52 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  30.09 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  32.16 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  29.81 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  29.81 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  26.73 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  29.81 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  28.31 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  29.81 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.04 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2306  GntR domain protein  30.87 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.78 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  30.05 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  28.57 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  31.82 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  28.28 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.22 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  29.68 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7453  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.12 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  27.92 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  26.99 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  26.91 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  30 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  24.77 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  28.07 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  28.03 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  28.03 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  33.33 
 
 		 239 aa  72  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.61 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.39 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0508  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0519  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  32.71 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0497  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.18 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1066  transcriptional regulator NanR  28.57 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624285  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0036  GntR domain-containing protein  24.79 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.33 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  26.91 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  29.87 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  25.57 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  29.52 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>