234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2022 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  520  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  57.96 
 
 
250 aa  273  2e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  46.32 
 
 
259 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  45.08 
 
 
257 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  45.21 
 
 
254 aa  222  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  50.67 
 
 
243 aa  214  1e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  48.86 
 
 
241 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  43.51 
 
 
255 aa  206  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  45.02 
 
 
259 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  46.75 
 
 
257 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  43.31 
 
 
243 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  43.14 
 
 
255 aa  201  1e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  42.13 
 
 
254 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  41.87 
 
 
251 aa  191  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  43.57 
 
 
244 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  41.53 
 
 
254 aa  184  1e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  40.68 
 
 
254 aa  182  4e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  37.94 
 
 
259 aa  182  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  42.31 
 
 
256 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  43.33 
 
 
246 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  38.55 
 
 
262 aa  175  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  39.91 
 
 
223 aa  174  1e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  38.3 
 
 
235 aa  174  2e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  40.68 
 
 
233 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  36.96 
 
 
224 aa  169  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  38.36 
 
 
233 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  39.09 
 
 
221 aa  162  4e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  39.64 
 
 
224 aa  162  4e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  38.29 
 
 
222 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  38.01 
 
 
227 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2383  hypothetical protein  46.93 
 
 
204 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.518006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  34.08 
 
 
232 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  35.87 
 
 
221 aa  152  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  33.62 
 
 
238 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  37.56 
 
 
222 aa  147  2e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  35.81 
 
 
222 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.09345e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  35.71 
 
 
227 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  39.38 
 
 
224 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  35.43 
 
 
253 aa  141  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  35.44 
 
 
248 aa  140  2e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  33.18 
 
 
226 aa  140  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  33.92 
 
 
234 aa  139  4e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  34.39 
 
 
232 aa  139  5e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  38.05 
 
 
236 aa  139  5e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  40.55 
 
 
221 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  37.5 
 
 
226 aa  136  3e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  32.46 
 
 
222 aa  135  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  32.42 
 
 
222 aa  135  7e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  32.88 
 
 
222 aa  134  1e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  32.88 
 
 
222 aa  134  1e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  34.92 
 
 
252 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  34.07 
 
 
219 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  3.98604e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  33.59 
 
 
290 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  34.2 
 
 
250 aa  132  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  33.48 
 
 
221 aa  132  8e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  34.57 
 
 
248 aa  131  8e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  36.1 
 
 
243 aa  131  1e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  38.67 
 
 
222 aa  130  2e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  9.51308e-05 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  34.27 
 
 
233 aa  129  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  36.02 
 
 
226 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  38.8 
 
 
224 aa  129  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  34.48 
 
 
239 aa  127  2e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  34.96 
 
 
242 aa  127  2e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  34.06 
 
 
231 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  33.09 
 
 
268 aa  126  4e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  34.5 
 
 
262 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  37.25 
 
 
252 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  35.5 
 
 
252 aa  125  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2115  protein of unknown function DUF159  32.14 
 
 
213 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  32.77 
 
 
261 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  32.09 
 
 
268 aa  120  2e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0924  hypothetical protein  34.67 
 
 
218 aa  120  2e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  35.02 
 
 
239 aa  120  2e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  32.64 
 
 
231 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  33.19 
 
 
234 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  31.05 
 
 
255 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  36.2 
 
 
253 aa  119  4e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  31.87 
 
 
252 aa  119  4e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  35.17 
 
 
248 aa  119  4e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19201  hypothetical protein  35.41 
 
 
218 aa  118  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  34.76 
 
 
234 aa  117  1e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  35.71 
 
 
252 aa  115  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  34.78 
 
 
254 aa  115  9e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  35.27 
 
 
226 aa  114  1e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1484  hypothetical protein  36.13 
 
 
215 aa  114  2e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  34.43 
 
 
240 aa  114  2e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  34.34 
 
 
253 aa  114  2e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  33.2 
 
 
256 aa  114  2e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  31.69 
 
 
253 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  31.72 
 
 
212 aa  113  4e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  35.9 
 
 
231 aa  112  7e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  30.83 
 
 
248 aa  111  1e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  28.9 
 
 
261 aa  111  1e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  30.09 
 
 
225 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  31.25 
 
 
281 aa  108  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  30.04 
 
 
240 aa  108  9e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  28.89 
 
 
266 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  28.89 
 
 
266 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  33.61 
 
 
274 aa  105  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  34.5 
 
 
253 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>