More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1986 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  100 
 
 
438 aa  877    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  65.68 
 
 
438 aa  590  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0475  FolC bifunctional protein  57.14 
 
 
441 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617675  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  60.32 
 
 
447 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  56.32 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  56.12 
 
 
448 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  56.02 
 
 
448 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  55.73 
 
 
447 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1623  FolC bifunctional protein  57.6 
 
 
441 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0060  FolC bifunctional protein  55.4 
 
 
442 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  54.94 
 
 
442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4444  FolC bifunctional protein  55.33 
 
 
441 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4908  FolC bifunctional protein  55.33 
 
 
441 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.094704  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4958  FolC bifunctional protein  55.33 
 
 
441 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  0.154774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0389  FolC bifunctional protein  57.44 
 
 
447 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251585  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2022  FolC bifunctional protein  51.38 
 
 
442 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000765521  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2106  FolC bifunctional protein  51.61 
 
 
442 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0277055  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0814  FolC bifunctional protein  52.8 
 
 
430 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3380  FolC bifunctional protein  53.74 
 
 
441 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  53.69 
 
 
423 aa  413  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  52.53 
 
 
421 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0662  FolC bifunctional protein  53.06 
 
 
440 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0116745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3957  FolC bifunctional protein  50.92 
 
 
442 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755042  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3240  FolC bifunctional protein  53.23 
 
 
447 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4284  FolC bifunctional protein  51.38 
 
 
442 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.045669  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0140  FolC bifunctional protein  53.76 
 
 
444 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  52.62 
 
 
422 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0024  folylpolyglutamate synthase  49.89 
 
 
470 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0930  folylpolyglutamate synthetase  53.69 
 
 
424 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  54.25 
 
 
412 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2589  FolC bifunctional protein  53 
 
 
424 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500866  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3431  folylpolyglutamate synthetase  50.56 
 
 
435 aa  360  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  50.46 
 
 
437 aa  353  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0132  folylpolyglutamate synthase  53.26 
 
 
422 aa  351  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1352  folylpolyglutamate synthase  44.06 
 
 
440 aa  341  2e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5701  FolC bifunctional protein  45.01 
 
 
467 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.504133  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0088  FolC bifunctional protein  48.39 
 
 
397 aa  335  7e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  44.36 
 
 
434 aa  334  2e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1052  folylpolyglutamate synthase  43.1 
 
 
429 aa  332  7.000000000000001e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.275241  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  49.54 
 
 
437 aa  330  4e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  47.43 
 
 
432 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  43.51 
 
 
435 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  45.12 
 
 
453 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1061  FolC bifunctional protein  43.82 
 
 
443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  39.01 
 
 
442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  42.53 
 
 
426 aa  273  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1299  FolC bifunctional protein  41.89 
 
 
435 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  35.55 
 
 
429 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  36.07 
 
 
434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  38.02 
 
 
431 aa  217  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  35.24 
 
 
432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  35.37 
 
 
425 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.35 
 
 
427 aa  212  9e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  38.32 
 
 
427 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  34.92 
 
 
424 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  37.07 
 
 
412 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  36.28 
 
 
425 aa  206  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  35.06 
 
 
420 aa  206  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  34.1 
 
 
457 aa  206  9e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  36.49 
 
 
422 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  35.08 
 
 
443 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  42.99 
 
 
386 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  33.78 
 
 
428 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  40.05 
 
 
403 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  35.52 
 
 
447 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  36.47 
 
 
422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  37.21 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  35.78 
 
 
424 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0902  FolC bifunctional protein  37.33 
 
 
432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  36.34 
 
 
425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  36.22 
 
 
459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  35.02 
 
 
422 aa  196  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  35.12 
 
 
424 aa  195  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.71 
 
 
466 aa  194  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1026  dihydrofolate synthase  36.89 
 
 
432 aa  194  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0203  FolC bifunctional protein  34.04 
 
 
418 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0053743 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  35.49 
 
 
437 aa  193  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0207  FolC bifunctional protein  34.28 
 
 
418 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  37.88 
 
 
440 aa  192  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  32.17 
 
 
441 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  34.89 
 
 
437 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  37.25 
 
 
430 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  34.94 
 
 
439 aa  190  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  33.97 
 
 
429 aa  190  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  31.58 
 
 
441 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  33.56 
 
 
426 aa  189  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.65 
 
 
431 aa  188  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  32.87 
 
 
407 aa  188  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  34.35 
 
 
416 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  30.54 
 
 
433 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  32.18 
 
 
435 aa  187  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  33.79 
 
 
436 aa  186  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.33 
 
 
433 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  31.46 
 
 
430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  31.44 
 
 
421 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  38.01 
 
 
431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  34.23 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 
424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0918  FolC bifunctional protein  35.5 
 
 
404 aa  184  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>