120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1910 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1910  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 382 aa  754    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  36.76 
 
 		 405 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1112  peptidoglycan-binding LysM  35.64 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  35.81 
 
 		 352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1930  peptidoglycan-binding LysM  30.41 
 
 		 503 aa  143  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0490055 
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  27.07 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  26.57 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1636  Peptidoglycan-binding LysM  34.95 
 
 		 451 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  31.13 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  30.3 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0461  peptidoglycan-binding LysM  35.47 
 
 		 439 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520913  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1352  peptidoglycan-binding LysM  31.18 
 
 		 440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.47776  normal  0.0441198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2688  peptidoglycan-binding LysM  30.28 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00047104  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2695  peptidoglycan-binding protein  30.88 
 
 		 440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4742  peptidoglycan-binding LysM  31.68 
 
 		 511 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  30.92 
 
 		 511 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  33.86 
 
 		 552 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1869  peptidoglycan-binding LysM  29.34 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  38.18 
 
 		 651 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1766  hypothetical protein  30.89 
 
 		 531 aa  90.1  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.905557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2193  peptidoglycan-binding LysM  35.16 
 
 		 521 aa  86.7  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  27.4 
 
 		 572 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1176  Peptidoglycan-binding LysM  24.91 
 
 		 676 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0861609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0972  peptidoglycan-binding LysM  31.45 
 
 		 546 aa  63.5  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  24.9 
 
 		 663 aa  59.7  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1024  Peptidoglycan-binding LysM  45.9 
 
 		 680 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  50 
 
 		 166 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 409 aa  53.1  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  50 
 
 		 167 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  43.28 
 
 		 168 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  44 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  43.28 
 
 		 168 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  48.98 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  48.98 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  48.98 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0258  LysM domain/BON superfamily protein  28.57 
 
 		 146 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0155386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0273  LysM domain/BON superfamily protein  28.57 
 
 		 146 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  39.34 
 
 		 1051 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  46.81 
 
 		 166 aa  50.1  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  47.92 
 
 		 195 aa  50.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1039  LysM domain-containing protein  40 
 
 		 243 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000199986  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2167  LysM domain/BON superfamily protein  45.83 
 
 		 156 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.420767  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  46 
 
 		 387 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  40.3 
 
 		 168 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0283  LysM domain/BON superfamily protein  30.43 
 
 		 146 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2427  LysM domain/BON superfamily protein  43.75 
 
 		 156 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  38.18 
 
 		 349 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  42.86 
 
 		 145 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2264  LysM domain/BON superfamily protein  43.75 
 
 		 156 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2304  LysM domain/BON superfamily protein  43.75 
 
 		 156 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  42.86 
 
 		 145 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  42 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  44 
 
 		 408 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4952  LysM domain/BON superfamily protein  26.79 
 
 		 150 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182933  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  35.92 
 
 		 97 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  44.68 
 
 		 149 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2975  LysM domain/BON superfamily protein  44.68 
 
 		 149 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.870465  normal  0.0673181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  44.68 
 
 		 149 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  44.68 
 
 		 149 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  44.68 
 
 		 149 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 		 440 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  45.83 
 
 		 158 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 		 377 aa  46.6  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2667  LysM domain/BON superfamily protein  44.68 
 
 		 158 aa  46.6  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000146101  normal  0.333538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 334 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  32.95 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  32.95 
 
 		 149 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3277  lysM domain-containing protein  40 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  45.65 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0282  LysM domain/BON superfamily protein  43.48 
 
 		 146 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  40.3 
 
 		 161 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  32.95 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  44 
 
 		 185 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  32.95 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  32.95 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  32.95 
 
 		 149 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  30.43 
 
 		 149 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  32.95 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  32.95 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  42.86 
 
 		 146 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1406  cation transport ATPase  43.4 
 
 		 1082 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3226  peptidoglycan-binding LysM  36.92 
 
 		 230 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.201779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1611  peptidoglycan-binding LysM  48 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000139366  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  40.38 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0425  peptidoglycan-binding LysM  48 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  29.17 
 
 		 5559 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  35.38 
 
 		 5561 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  35.38 
 
 		 5561 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  40.38 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  35.38 
 
 		 5561 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  35.38 
 
 		 5559 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  38 
 
 		 350 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  42 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3255  LysM domain/BON superfamily protein  40.82 
 
 		 157 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  42.55 
 
 		 148 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>