More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1884 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 389 aa  783    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 		 798 aa  242  9e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.64 
 
 		 523 aa  240  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.39 
 
 		 502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.41 
 
 		 617 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.2 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  50.21 
 
 		 778 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  47.22 
 
 		 773 aa  227  3e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49 
 
 		 717 aa  227  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  48.79 
 
 		 620 aa  222  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  46.56 
 
 		 599 aa  220  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.1 
 
 		 518 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.54 
 
 		 969 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 		 1192 aa  215  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 		 513 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 		 605 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 770 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 1000 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.420098  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 		 774 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  41.5 
 
 		 503 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 		 587 aa  212  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  42.31 
 
 		 1035 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0848  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.7 
 
 		 513 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0912  ATPase domain-containing protein  47.7 
 
 		 513 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0873  histidine kinase  47.7 
 
 		 513 aa  210  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  46.96 
 
 		 525 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.96 
 
 		 769 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 		 779 aa  208  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 627 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 		 456 aa  208  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  41.92 
 
 		 1035 aa  208  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  35.48 
 
 		 544 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 784 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  48.76 
 
 		 508 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  46.81 
 
 		 771 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  45.59 
 
 		 532 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 		 1055 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2079  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 		 511 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  0.759382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  46.38 
 
 		 771 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2316  histidine kinase  45.64 
 
 		 511 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 511 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  45.23 
 
 		 513 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 		 512 aa  206  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 		 594 aa  206  8e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 		 773 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 		 533 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 		 844 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 		 1276 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.09 
 
 		 911 aa  205  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 		 600 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 614 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1352 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 		 531 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 1138 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 530 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 		 775 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 		 1296 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 		 775 aa  202  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 		 505 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2051  two component sensor kinase  43.51 
 
 		 511 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.19 
 
 		 763 aa  202  9e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  45.16 
 
 		 790 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  44.53 
 
 		 783 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  44.53 
 
 		 783 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.47 
 
 		 607 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 		 536 aa  200  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  33.58 
 
 		 598 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 		 530 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  42.74 
 
 		 774 aa  199  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 728 aa  199  9e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  42.22 
 
 		 1046 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.98 
 
 		 610 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1749  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.23 
 
 		 511 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  43.98 
 
 		 470 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 		 536 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.71 
 
 		 687 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.83 
 
 		 772 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  47.01 
 
 		 461 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  47.01 
 
 		 461 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  39.53 
 
 		 1410 aa  196  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  46.58 
 
 		 461 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  42.08 
 
 		 470 aa  195  1e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 769 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1779  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.93 
 
 		 612 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 782 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1561  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  43.33 
 
 		 464 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 568 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 442 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 769 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 442 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 		 468 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  43.9 
 
 		 565 aa  190  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 764 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  42.48 
 
 		 729 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.83 
 
 		 786 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 836 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  43.83 
 
 		 786 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>