More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1738 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0783  chaperonin GroEL  64.95 
 
 
550 aa  682  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  3.75112e-05  normal  0.275175 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0483  chaperonin GroEL  66.98 
 
 
549 aa  702  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3997  chaperonin GroEL  68.5 
 
 
546 aa  717  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.113268 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1693  chaperonin GroEL  66.67 
 
 
547 aa  716  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.274413  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6727  chaperonin GroEL  64.63 
 
 
540 aa  685  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5580  chaperonin GroEL  76.84 
 
 
546 aa  819  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5463  chaperonin GroEL  78.88 
 
 
551 aa  835  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1771  chaperonin GroEL  79.21 
 
 
545 aa  844  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190882  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0831  chaperonin GroEL  67.17 
 
 
546 aa  694  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00374886  decreased coverage  3.89435e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4308  chaperonin GroEL  65.48 
 
 
550 aa  685  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0534  chaperonin GroEL  79.66 
 
 
546 aa  845  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.282676  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0968  chaperonin GroEL  67.17 
 
 
546 aa  700  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.140155 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4612  chaperonin GroEL  66.42 
 
 
548 aa  689  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.562715 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  61.42 
 
 
538 aa  644  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3869  chaperonin GroEL  66.42 
 
 
548 aa  689  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.749849 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3822  chaperonin GroEL  66.98 
 
 
548 aa  696  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4150  chaperonin GroEL  78.24 
 
 
548 aa  812  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00153421  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1518  chaperonin GroEL  65.47 
 
 
547 aa  685  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  1.06639e-06  normal  0.660636 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0750  chaperonin GroEL  67.36 
 
 
546 aa  697  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.20211  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3451  chaperonin GroEL  68.31 
 
 
546 aa  716  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201632  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0308  chaperonin GroEL  65.97 
 
 
544 aa  696  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.541583 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  65.79 
 
 
548 aa  704  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0498  chaperonin GroEL  66.1 
 
 
547 aa  686  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  6.58221e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0586  chaperonin GroEL  63.23 
 
 
544 aa  674  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5325  chaperonin GroEL  78.53 
 
 
546 aa  831  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03703  chaperonin GroEL  67.6 
 
 
546 aa  726  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3427  chaperonin GroEL  66.29 
 
 
540 aa  702  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0579  chaperonin GroEL  66.04 
 
 
547 aa  692  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158784  normal  0.586113 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0864  chaperonin GroEL  66.54 
 
 
546 aa  689  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  1.44467e-05  normal  0.0762282 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4672  chaperonin GroEL  66.42 
 
 
548 aa  689  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  62.12 
 
 
550 aa  659  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2333  chaperonin GroEL  66.6 
 
 
546 aa  692  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0883149  normal  0.0155748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1738  chaperonin GroEL  100 
 
 
548 aa  1077  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.280539  decreased coverage  0.00152275 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1623  chaperonin GroEL  67.23 
 
 
547 aa  724  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2054  chaperonin GroEL  65.97 
 
 
544 aa  697  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6096  chaperonin GroEL  67.04 
 
 
540 aa  709  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4488  chaperonin GroEL  67.42 
 
 
547 aa  704  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0309413  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4782  chaperonin GroEL  78.87 
 
 
546 aa  833  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3334  chaperonin GroEL  73.04 
 
 
540 aa  798  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0610  chaperonin GroEL  74.19 
 
 
550 aa  764  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.271913 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0308  chaperonin GroEL  63.86 
 
 
544 aa  665  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0755477  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0568  chaperonin GroEL  62.73 
 
 
543 aa  656  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  4.40547e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3675  chaperonin GroEL  66.98 
 
 
548 aa  696  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0509  chaperonin GroEL  62.17 
 
 
545 aa  649  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  3.31966e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  66.98 
 
 
547 aa  717  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1472  chaperonin GroEL  66.92 
 
 
547 aa  701  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0166914  normal  0.319334 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3026  chaperonin GroEL  75.24 
 
 
546 aa  772  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0645  chaperonin GroEL  66.03 
 
 
545 aa  684  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4956  chaperonin GroEL  67.94 
 
 
547 aa  699  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34034  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2037  chaperonin GroEL  64.35 
 
 
547 aa  686  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161306  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1281  chaperonin GroEL  75.59 
 
 
542 aa  845  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.127549  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0804  chaperonin GroEL  73.82 
 
 
542 aa  826  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451933  normal  0.636529 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0408  chaperonin GroEL  77.97 
 
 
545 aa  830  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.522888 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6084  chaperonin GroEL  77.4 
 
 
545 aa  825  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.879265  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4130  chaperonin GroEL  71.88 
 
 
544 aa  784  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.800331  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1166  chaperonin GroEL  77.55 
 
 
548 aa  808  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.89242  normal  0.956764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4264  chaperonin GroEL  81.15 
 
 
543 aa  846  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.154167  normal  0.0469061 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0287  chaperonin GroEL  65.73 
 
 
552 aa  706  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  3.93634e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0741  chaperonin GroEL  78.09 
 
 
548 aa  838  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0722  chaperonin GroEL  66.98 
 
 
548 aa  696  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1908  chaperonin GroEL  65.54 
 
 
552 aa  705  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5253  chaperonin GroEL  66.6 
 
 
540 aa  691  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2528  chaperonin GroEL  67.74 
 
 
546 aa  699  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0382557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5661  chaperonin GroEL  67.66 
 
 
547 aa  703  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00217744  hitchhiker  0.00916783 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0672  chaperonin GroEL  66.1 
 
 
545 aa  688  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342716  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2919  chaperonin GroEL  73.35 
 
 
547 aa  778  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0550  chaperonin GroEL  65.6 
 
 
550 aa  674  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.28824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3689  chaperonin GroEL  66.03 
 
 
547 aa  675  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0409  chaperonin GroEL  67.42 
 
 
548 aa  696  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0642  chaperonin GroEL  66.1 
 
 
549 aa  683  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0667  chaperonin GroEL  64.04 
 
 
544 aa  664  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4698  chaperonin GroEL  66.42 
 
 
548 aa  689  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4384  chaperonin GroEL  66.42 
 
 
548 aa  689  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00142  chaperonin GroEL  66.16 
 
 
548 aa  691  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0638  chaperonin GroEL  64.46 
 
 
548 aa  684  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00670  chaperonin GroEL  66.35 
 
 
544 aa  686  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6245  chaperonin GroEL  63.32 
 
 
544 aa  676  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0243  chaperonin GroEL  65.46 
 
 
547 aa  679  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.649661  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2734  chaperonin GroEL  65.03 
 
 
543 aa  686  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.657251 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  65.78 
 
 
547 aa  697  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0509  chaperonin GroEL  66.85 
 
 
548 aa  698  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.622301  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3529  chaperonin GroEL  66.48 
 
 
548 aa  696  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.249463  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03975  hypothetical protein  66.42 
 
 
548 aa  689  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3403  chaperonin GroEL  66.48 
 
 
548 aa  696  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3081  chaperonin GroEL  66.48 
 
 
540 aa  703  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0535  chaperonin GroEL  66.54 
 
 
547 aa  695  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793994  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5849  chaperonin GroEL  78.45 
 
 
542 aa  847  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471391  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1044  chaperonin GroEL  74.82 
 
 
544 aa  811  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0515  chaperonin GroEL  76.04 
 
 
547 aa  813  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.128762 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5038  chaperonin GroEL  77.13 
 
 
542 aa  841  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.473372  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1118  chaperonin GroEL  67.23 
 
 
550 aa  699  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13480  chaperonin GroEL  66.36 
 
 
546 aa  701  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.434878  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0317  chaperonin GroEL  64.82 
 
 
544 aa  692  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000185818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2624  chaperonin GroEL  65.03 
 
 
545 aa  689  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  61.62 
 
 
538 aa  659  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  7.3104e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  62.19 
 
 
543 aa  662  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2524  chaperonin GroEL  61.89 
 
 
539 aa  647  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1089  chaperonin GroEL  59.85 
 
 
545 aa  651  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  3.83154e-07  normal  0.0318123 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0292  chaperonin GroEL  66.29 
 
 
552 aa  707  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0385271  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0984  chaperonin GroEL  63.76 
 
 
545 aa  669  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488332  normal  0.74927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>