More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1730 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  100 
 
 
389 aa  792  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  67.55 
 
 
368 aa  496  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  53.51 
 
 
383 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  51.55 
 
 
385 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  52.53 
 
 
389 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  50.66 
 
 
383 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  51.81 
 
 
390 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  53.8 
 
 
385 aa  352  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  51.12 
 
 
382 aa  348  7e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  50.44 
 
 
389 aa  337  2e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  51.04 
 
 
379 aa  337  3e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  51.98 
 
 
379 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  50 
 
 
386 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  51.7 
 
 
382 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  52.96 
 
 
382 aa  323  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  49.45 
 
 
394 aa  316  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  44.01 
 
 
398 aa  279  8e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  43.43 
 
 
360 aa  273  4e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  45.92 
 
 
407 aa  272  6e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  47.04 
 
 
382 aa  270  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  39.14 
 
 
399 aa  269  6e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  42.99 
 
 
393 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  44.66 
 
 
394 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  42.63 
 
 
393 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  45.95 
 
 
379 aa  253  5e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  43.52 
 
 
387 aa  249  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  42.15 
 
 
361 aa  249  5e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  42.17 
 
 
395 aa  248  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  39.48 
 
 
367 aa  246  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  4.27817e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  42.33 
 
 
359 aa  243  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  41.21 
 
 
433 aa  240  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  40.83 
 
 
388 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  41.41 
 
 
436 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  38.44 
 
 
405 aa  237  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  42.02 
 
 
475 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  38.58 
 
 
447 aa  235  1e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  41.54 
 
 
477 aa  235  1e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  40.72 
 
 
362 aa  234  2e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  41.82 
 
 
394 aa  233  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  38.1 
 
 
503 aa  233  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  38.36 
 
 
435 aa  233  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  40.97 
 
 
376 aa  232  8e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  41.41 
 
 
399 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  37.66 
 
 
498 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  40.67 
 
 
393 aa  229  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  37.43 
 
 
464 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  42.67 
 
 
413 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  36.92 
 
 
403 aa  226  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  36.64 
 
 
355 aa  226  6e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  40 
 
 
378 aa  226  7e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  40.97 
 
 
387 aa  225  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  41.91 
 
 
447 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  38.56 
 
 
451 aa  222  1e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  35.81 
 
 
344 aa  222  1e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  38.56 
 
 
451 aa  222  1e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  38.56 
 
 
471 aa  221  2e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  37.91 
 
 
457 aa  221  2e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  38.71 
 
 
395 aa  219  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  37.93 
 
 
452 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  38.24 
 
 
456 aa  217  3e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  39.94 
 
 
393 aa  217  3e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  35.83 
 
 
357 aa  216  5e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  40.14 
 
 
391 aa  215  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  2.87062e-07 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  38.94 
 
 
383 aa  215  1e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  39.13 
 
 
464 aa  214  3e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  40.78 
 
 
406 aa  213  4e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  37.3 
 
 
471 aa  213  4e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  39.93 
 
 
397 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  39.93 
 
 
397 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  1.45898e-09 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  38.21 
 
 
333 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.5812e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  38.46 
 
 
362 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  39.22 
 
 
360 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  38.87 
 
 
347 aa  208  1e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  5.64548e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  36.22 
 
 
474 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  40.5 
 
 
359 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  35.44 
 
 
383 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  34.93 
 
 
384 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  42.14 
 
 
309 aa  203  5e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  35.2 
 
 
420 aa  201  1e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  34.65 
 
 
382 aa  201  2e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  36.36 
 
 
407 aa  201  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  34.88 
 
 
414 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  6.33953e-12 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  38.77 
 
 
308 aa  196  4e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  34.48 
 
 
459 aa  196  5e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  3.63385e-10 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  38.28 
 
 
399 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  38.77 
 
 
308 aa  196  6e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  39.86 
 
 
370 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  32.5 
 
 
465 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  7.6277e-06 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  37.95 
 
 
400 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  39.18 
 
 
331 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  35.74 
 
 
418 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  37.22 
 
 
393 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  38.99 
 
 
306 aa  193  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  37.22 
 
 
405 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0579  HflK protein  31.33 
 
 
386 aa  193  5e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  30.31 
 
 
460 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  36.98 
 
 
395 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3719  FtsH protease regulator HflK  37.07 
 
 
420 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0503077  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  30.05 
 
 
466 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  3.21559e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  37.75 
 
 
393 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>