266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1729 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1729  dihydrofolate reductase  100 
 
 
198 aa  401  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000733059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0603  Dihydrofolate reductase  57.23 
 
 
174 aa  162  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.052544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  45.88 
 
 
179 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  47.67 
 
 
195 aa  152  3e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  46.75 
 
 
178 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 
179 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  41.92 
 
 
169 aa  147  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  43.03 
 
 
171 aa  147  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 
171 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  46.79 
 
 
180 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  42.17 
 
 
170 aa  140  1e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 
171 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
166 aa  138  4e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  43.98 
 
 
178 aa  139  4e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  40.36 
 
 
160 aa  138  5e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  41.42 
 
 
170 aa  137  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  42.11 
 
 
171 aa  137  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  41.57 
 
 
160 aa  137  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
172 aa  137  8e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  45.39 
 
 
170 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 
166 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 
170 aa  136  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 
166 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  45.18 
 
 
163 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  40.36 
 
 
160 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 
160 aa  135  3e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  38.79 
 
 
163 aa  135  3e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 
160 aa  135  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  41.21 
 
 
167 aa  135  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  39.29 
 
 
171 aa  135  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  47.86 
 
 
168 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  44.68 
 
 
170 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  45.89 
 
 
171 aa  134  1e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  41.57 
 
 
160 aa  133  1e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.8363e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  45.89 
 
 
171 aa  134  1e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  41.21 
 
 
178 aa  133  1e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  43.2 
 
 
176 aa  134  1e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  40.36 
 
 
160 aa  134  1e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  41.38 
 
 
171 aa  133  1e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  47.31 
 
 
160 aa  132  2e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  44.24 
 
 
167 aa  133  2e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  40.61 
 
 
165 aa  133  2e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  42.07 
 
 
166 aa  132  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 
160 aa  132  4e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  39.29 
 
 
162 aa  132  4e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.74022e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  40.36 
 
 
160 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  40.36 
 
 
160 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  40.36 
 
 
160 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  41.21 
 
 
163 aa  131  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  43.03 
 
 
167 aa  130  1e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  35.37 
 
 
161 aa  130  1e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  8.86123e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  39.52 
 
 
160 aa  129  2e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  38.55 
 
 
160 aa  129  2e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  43.03 
 
 
167 aa  130  2e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  40.72 
 
 
166 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  44.67 
 
 
159 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  37.95 
 
 
160 aa  129  4e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  41.82 
 
 
187 aa  128  5e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  39.52 
 
 
172 aa  128  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  42.21 
 
 
161 aa  127  7e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  38.79 
 
 
167 aa  128  7e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  38.79 
 
 
167 aa  128  7e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  44.05 
 
 
292 aa  127  1e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  6.27481e-07  hitchhiker  3.05943e-05 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  42.07 
 
 
166 aa  127  1e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  40.85 
 
 
166 aa  126  2e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  38.69 
 
 
160 aa  126  2e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2312  dihydrofolate reductase  46.21 
 
 
160 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  39.76 
 
 
172 aa  125  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  42.67 
 
 
159 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  39.53 
 
 
160 aa  125  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  2.43395e-05 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  43.64 
 
 
171 aa  124  8e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  37.87 
 
 
183 aa  124  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  41.43 
 
 
164 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  40 
 
 
169 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  39.16 
 
 
169 aa  124  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 
169 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 
163 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  38.79 
 
 
174 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  42.77 
 
 
161 aa  122  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  40.72 
 
 
173 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  35.98 
 
 
163 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  35.76 
 
 
161 aa  122  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  39.76 
 
 
165 aa  122  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  38.1 
 
 
172 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  47.14 
 
 
168 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  44.3 
 
 
161 aa  121  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  37.5 
 
 
172 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  32.73 
 
 
162 aa  120  1e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
162 aa  119  2e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
162 aa  119  2e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
162 aa  119  2e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  38.18 
 
 
164 aa  120  2e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
162 aa  119  2e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.30652e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  40.61 
 
 
163 aa  119  2e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
162 aa  119  2e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
162 aa  119  2e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 
219 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  38.79 
 
 
167 aa  119  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  32.73 
 
 
162 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  33.33 
 
 
162 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>