More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1712 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  64.64 
 
 		 688 aa  890    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1232  excinuclease ABC subunit C  62.68 
 
 		 680 aa  808    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101228 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  57.82 
 
 		 631 aa  745    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  62.16 
 
 		 704 aa  797    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2652  excinuclease ABC, C subunit  68.63 
 
 		 668 aa  867    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  60.44 
 
 		 690 aa  823    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1434  excinuclease ABC, C subunit  75 
 
 		 679 aa  1008    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3713  excinuclease ABC, C subunit  67.68 
 
 		 668 aa  871    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  57.87 
 
 		 623 aa  746    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4277  excinuclease ABC subunit C  58.9 
 
 		 634 aa  754    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  66.77 
 
 		 682 aa  896    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  54.78 
 
 		 629 aa  701    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2526  excinuclease ABC subunit C  63.12 
 
 		 666 aa  803    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  57.71 
 
 		 623 aa  745    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  62.48 
 
 		 691 aa  838    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0782  excinuclease ABC subunit C  61.14 
 
 		 674 aa  835    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191761  normal  0.0714693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1728  excinuclease ABC subunit C  61.5 
 
 		 688 aa  778    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2276  excinuclease ABC, C subunit  61.12 
 
 		 644 aa  784    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  52.89 
 
 		 639 aa  683    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  66.93 
 
 		 682 aa  897    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0420  excinuclease ABC subunit C  55.14 
 
 		 620 aa  678    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000882939  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  67.29 
 
 		 700 aa  899    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  61.45 
 
 		 695 aa  791    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  51.72 
 
 		 658 aa  645    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  56.83 
 
 		 631 aa  733    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0901  excinuclease ABC subunit C  62.56 
 
 		 699 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.686054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1558  excinuclease ABC subunit C  62.64 
 
 		 690 aa  813    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  57.89 
 
 		 623 aa  742    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  59 
 
 		 695 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3146  excinuclease ABC subunit C  62.5 
 
 		 690 aa  816    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.055346  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1712  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 692 aa  1414    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  56.12 
 
 		 635 aa  728    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  52.06 
 
 		 644 aa  669    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2344  excinuclease ABC, C subunit  66.67 
 
 		 779 aa  672    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.77277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  63.32 
 
 		 653 aa  852    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0516  excinuclease ABC subunit C  57.67 
 
 		 658 aa  783    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  62.68 
 
 		 680 aa  811    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  60.44 
 
 		 690 aa  823    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0772  excinuclease ABC subunit C  56.07 
 
 		 633 aa  729    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00962744  normal  0.347624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4491  excinuclease ABC subunit C  54.46 
 
 		 642 aa  674    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.191027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2312  excinuclease ABC subunit C  57.64 
 
 		 623 aa  718    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  44.72 
 
 		 609 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  44.21 
 
 		 611 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  42.65 
 
 		 613 aa  484  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  41.97 
 
 		 617 aa  474  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  41.28 
 
 		 626 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  40.59 
 
 		 599 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  43.49 
 
 		 607 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  39.33 
 
 		 613 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  41.79 
 
 		 603 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  40.42 
 
 		 610 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  40.58 
 
 		 610 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  40.42 
 
 		 610 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0659  excinuclease ABC subunit C  38.28 
 
 		 609 aa  451  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.25379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  40.42 
 
 		 610 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  40.42 
 
 		 610 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  40.59 
 
 		 623 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 608 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  40.26 
 
 		 610 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 608 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  40.59 
 
 		 608 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  40.42 
 
 		 610 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0154  excinuclease ABC subunit C  38.51 
 
 		 605 aa  444  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.168899  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  38.87 
 
 		 627 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  40.19 
 
 		 610 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1174  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 610 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294093  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  38.87 
 
 		 621 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2102  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 610 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000495467  normal  0.0150424 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  40.19 
 
 		 617 aa  446  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3241  excinuclease ABC, C subunit  39.9 
 
 		 607 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0161382  hitchhiker  0.00210477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  38.45 
 
 		 674 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  39.41 
 
 		 607 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 610 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  40.06 
 
 		 657 aa  445  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  40.19 
 
 		 610 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  38.9 
 
 		 599 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2161  excinuclease ABC subunit C  39.94 
 
 		 610 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138205  hitchhiker  0.0000000035589 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1297  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 610 aa  442  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000512015  hitchhiker  0.00000387597 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  39.39 
 
 		 617 aa  442  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01878  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 		 588 aa  439  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000583054  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2668  excinuclease ABC subunit C  40.58 
 
 		 610 aa  438  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0146387  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  37.97 
 
 		 677 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  40.33 
 
 		 618 aa  437  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1019  excinuclease ABC subunit C  37.87 
 
 		 684 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114773  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  39.25 
 
 		 607 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3270  excinuclease ABC subunit C  38.2 
 
 		 639 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  39.09 
 
 		 607 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  39.11 
 
 		 607 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1023  excinuclease ABC subunit C  37.57 
 
 		 684 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 598 aa  435  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  39.25 
 
 		 607 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1451  excinuclease ABC subunit C  39.45 
 
 		 610 aa  434  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1519  excinuclease ABC subunit C  39.45 
 
 		 610 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0983209  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0663  excinuclease ABC subunit C  37.59 
 
 		 681 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.912465  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1143  excinuclease ABC subunit C  37.59 
 
 		 681 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1101  excinuclease ABC subunit C  37.54 
 
 		 682 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  39.09 
 
 		 607 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  39.37 
 
 		 619 aa  432  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2500  excinuclease ABC subunit C  39.77 
 
 		 607 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000123696  normal  0.60847 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0834  excinuclease ABC subunit C  38.21 
 
 		 610 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000370037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>