216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1642 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1642  MucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  286  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.326969  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  89.71 
 
 		 137 aa  256  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  71.32 
 
 		 139 aa  208  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  68.57 
 
 		 138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  65.67 
 
 		 137 aa  197  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 137 aa  196  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  67.67 
 
 		 138 aa  196  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  65.22 
 
 		 139 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  65.87 
 
 		 138 aa  186  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1774  MucR family transcriptional regulator  67.67 
 
 		 138 aa  182  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.257701  normal  0.0107118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  67.42 
 
 		 155 aa  180  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  61.59 
 
 		 145 aa  176  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  63.78 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  60.14 
 
 		 145 aa  173  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  60.14 
 
 		 145 aa  173  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4157  transcriptional regulator, MucR family  63.08 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  61.42 
 
 		 154 aa  169  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0871  MucR family transcriptional regulator  59.7 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0229033  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  55.97 
 
 		 175 aa  168  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  55.97 
 
 		 175 aa  167  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0614  MucR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  55.22 
 
 		 171 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0881  transcriptional regulator, MucR family  58.45 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000502539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1007  transcriptional regulator, MucR family  62.02 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00000996062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0569  Ros/MucR family transcriptional regulator  62.9 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.402998  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0423  Ros/MucR family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.970108  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0570  Ros/MucR family transcriptional regulator  62.9 
 
 		 161 aa  160  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  56.62 
 
 		 140 aa  160  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2690  MucR family transcriptional regulator  62.1 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6371  MucR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 137 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  55.64 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1357  MucR family transcriptional regulator  57.48 
 
 		 141 aa  157  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.067604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  58.91 
 
 		 138 aa  157  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1277  transcriptional regulator  55.94 
 
 		 143 aa  156  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  54.01 
 
 		 148 aa  156  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5993  MucR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 149 aa  153  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6057  MucR family transcriptional regulator  53.73 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1829  MucR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 139 aa  150  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 168 aa  150  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1890  MucR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 183 aa  147  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1917  MucR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  52.99 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6742  MucR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1538  MucR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2100  transcriptional regulator, MucR family  52.99 
 
 		 134 aa  144  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2067  MucR family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587924  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  54.48 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  55.28 
 
 		 159 aa  143  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3684  transcriptional regulator, MucR family  58.06 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  56 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3048  MucR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  55.22 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  58.2 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  56.06 
 
 		 166 aa  141  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3574  transcriptional regulator, MucR family  55.37 
 
 		 185 aa  141  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0283517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  58.54 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1770  MucR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202231  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0985  MucR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.933762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6541  transcriptional regulator, MucR family  53.85 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 133 aa  137  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 145 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0075  MucR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 166 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6298  MucR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 142 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  54.47 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1802  MucR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  54.62 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 174 aa  134  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  51.09 
 
 		 168 aa  133  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  52.21 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  50 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4938  transcriptional regulator, MucR family  50.39 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686756  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4474  ROSMUCR transcriptional regulator  50.39 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5627  transcriptional regulator, MucR family  55.12 
 
 		 174 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.698408  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  52.34 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4944  MucR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  48.91 
 
 		 150 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0587  MucR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0109398  hitchhiker  0.00472777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4988  transcriptional regulator, MucR family  48.84 
 
 		 177 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103901  normal  0.173335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3505  transcriptional regulator, MucR family  54.33 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  53.49 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5488  MucR family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622801  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  53.49 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3787  ROSMUCR transcriptional regulator  48.94 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  50.38 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8753  transcriptional regulator, MucR family  52.24 
 
 		 175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286217  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0068  transcriptional regulator, MucR family  53.49 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4669  MucR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 169 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4116  MucR family transcriptional regulator  50.37 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0549  transcriptional regulator, MucR family  49.61 
 
 		 147 aa  127  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973698  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4463  ROSMUCR transcriptional regulator  49.29 
 
 		 177 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4927  transcriptional regulator, MucR family  49.29 
 
 		 177 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>