57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1566 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  100 
 
 
231 aa  465  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  56.64 
 
 
234 aa  241  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  39.07 
 
 
220 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  39.35 
 
 
223 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  43.98 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  38.43 
 
 
223 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  38.43 
 
 
223 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  39.25 
 
 
223 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  37.85 
 
 
223 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  42.47 
 
 
248 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  46.5 
 
 
225 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  37.85 
 
 
221 aa  161  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  37.85 
 
 
223 aa  161  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  42.79 
 
 
268 aa  155  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  38.5 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  37.61 
 
 
222 aa  125  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2186  uridine kinase  37.09 
 
 
223 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.717082  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  36.59 
 
 
164 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0431  uridine kinase  36.69 
 
 
207 aa  90.1  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2745  hypothetical protein  46.75 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4433  uridine kinase  28.37 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4235  hypothetical protein  25.82 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2744  hypothetical protein  36.26 
 
 
105 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0994868 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2509  hypothetical protein  26.56 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.170262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2543  uridine kinase  27.08 
 
 
198 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577655  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  25.35 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1411  hypothetical protein  28.77 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466513  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1177  hypothetical protein  23.96 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0707692 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  25.35 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10760  hypothetical protein  27.92 
 
 
214 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.729368  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16890  hypothetical protein  24.76 
 
 
208 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144675  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7532  hypothetical protein  32.32 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1887  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3009  uridine kinase  24.47 
 
 
193 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2797  uridine kinase  24.47 
 
 
193 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00104076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2829  putative uridine kinase  24.43 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3007  uridine kinase  24.47 
 
 
193 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1086  hypothetical protein  28 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2728  uridine kinase  24.19 
 
 
193 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3044  uridine kinase  23.37 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2233  uridine kinase  23.78 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.640057  hitchhiker  0.0000000180687 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04382  kinase-related protein (AFU_orthologue; AFUA_4G06710)  31.58 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.608845  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5598  histidinol-phosphate phosphatase family protein  25.6 
 
 
649 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0839  hypothetical protein  28.04 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3635  para-aminobenzoate synthase, subunit I  27.41 
 
 
719 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3095  uridine kinase  39.58 
 
 
63 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000413913  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0128  putative fructose transport system kinase  27.52 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496094  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3098  uridine kinase  40.43 
 
 
74 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.444775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2807  uridine kinase  25 
 
 
189 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.560437  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4333  pantothenate kinase  27.93 
 
 
316 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000268532  hitchhiker  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3045  uridine kinase  23.4 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.215805  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4546  phosphoribulokinase/uridine kinase  26.77 
 
 
217 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1788  phosphoribulokinase/uridine kinase  30.13 
 
 
226 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1741  phosphoribulokinase/uridine kinase  30.13 
 
 
226 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4538  stage IV sporulation protein FB  32.18 
 
 
286 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.214848  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  39.06 
 
 
1416 aa  42  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  23.35 
 
 
207 aa  42  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>