105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1484 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 319 aa  643    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.66 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.6 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.01 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.7 
 
 		 304 aa  155  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.93 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.56 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 319 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 		 318 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.17 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 		 329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.68 
 
 		 324 aa  119  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.01 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.25 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.25 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 		 300 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 		 332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.9 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.88 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.03 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  25.83 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  32.48 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.55 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.11 
 
 		 304 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.95 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 		 352 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.22 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.23 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.71 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.99 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  29.67 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  30.71 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  30.71 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.71 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.71 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  30.71 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  27.16 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  26.62 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 326 aa  53.5  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1716  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.32 
 
 		 373 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  24.2 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.21 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  26.28 
 
 		 289 aa  45.8  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.57 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1745  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  25.19 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.174057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3156  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.71 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274992  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.41 
 
 		 388 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.08 
 
 		 370 aa  43.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>