More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1468 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
277 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.64 
 
 
274 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1152  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.54 
 
 
258 aa  364  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.33 
 
 
276 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.58 
 
 
283 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 
285 aa  353  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.68 
 
 
276 aa  349  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.39 
 
 
283 aa  340  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
279 aa  299  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 
281 aa  297  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.61 
 
 
282 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.38 
 
 
280 aa  261  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 
279 aa  258  7e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 
279 aa  258  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.36 
 
 
280 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 
296 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.35 
 
 
280 aa  242  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.92 
 
 
299 aa  241  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.09 
 
 
281 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
276 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
280 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  47.64 
 
 
286 aa  234  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.1 
 
 
284 aa  234  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.84 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
274 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.27 
 
 
276 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  46.21 
 
 
278 aa  232  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.48 
 
 
287 aa  230  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.26 
 
 
293 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 
276 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  46.01 
 
 
280 aa  222  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
275 aa  222  7e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
276 aa  221  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  45.26 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.57 
 
 
282 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  45.62 
 
 
280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  45.42 
 
 
280 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
282 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
292 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.93 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 
284 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.57 
 
 
278 aa  215  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.07 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  44.93 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  42.7 
 
 
284 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  43.68 
 
 
280 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
277 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  44.32 
 
 
284 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  41.34 
 
 
278 aa  207  1e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  42.49 
 
 
274 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  42.49 
 
 
274 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  42.49 
 
 
274 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.6 
 
 
285 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00800542  normal  0.26199 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
286 aa  207  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  42.44 
 
 
282 aa  205  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.24 
 
 
282 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.28 
 
 
274 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.04 
 
 
294 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  43.59 
 
 
285 aa  202  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.52 
 
 
279 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.88 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
283 aa  199  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366194  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  42.18 
 
 
303 aa  198  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.35 
 
 
285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.239273 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.09 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
291 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  40.43 
 
 
275 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
280 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
273 aa  195  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
282 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  42.28 
 
 
283 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  41.56 
 
 
282 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.2 
 
 
295 aa  193  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
272 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
281 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
272 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
293 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  38.24 
 
 
275 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 
286 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 
276 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 
291 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 
291 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.14 
 
 
291 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 
279 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  40.86 
 
 
286 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
291 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
293 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 
292 aa  188  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0160935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 
290 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 
275 aa  188  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  41.09 
 
 
276 aa  188  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
272 aa  188  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>