More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1456 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  491  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  64.11 
 
 
248 aa  318  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.52 
 
 
248 aa  295  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  44.88 
 
 
254 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  45.42 
 
 
252 aa  195  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 
257 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  43.03 
 
 
257 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  43.31 
 
 
254 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  43.31 
 
 
254 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  45.02 
 
 
252 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  44.09 
 
 
254 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  43.31 
 
 
257 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  43.31 
 
 
257 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  42.52 
 
 
254 aa  191  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  45.02 
 
 
252 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  42.52 
 
 
254 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  44.62 
 
 
252 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  45.42 
 
 
252 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  45.42 
 
 
252 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  45.02 
 
 
252 aa  187  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  44.22 
 
 
252 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  44.62 
 
 
252 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
253 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
259 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 
254 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 
257 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
247 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5176  short-chain dehydrogenase  43.78 
 
 
254 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340709  hitchhiker  0.00401231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
246 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
262 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
244 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
254 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
256 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
253 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
254 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
247 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
263 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.78 
 
 
246 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
248 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
253 aa  155  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  39.84 
 
 
264 aa  155  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
254 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
253 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
248 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.37 
 
 
246 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06560  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 
245 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
249 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
255 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
246 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
248 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1224  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  40 
 
 
255 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0621066  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
255 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
248 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
250 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
248 aa  148  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 
249 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
256 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
248 aa  148  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0065631  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  38.62 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000552143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
253 aa  146  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
251 aa  146  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
248 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
254 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
251 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
249 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
254 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.21 
 
 
250 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
253 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
250 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  40.73 
 
 
255 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.59 
 
 
246 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
247 aa  144  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 
246 aa  144  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
251 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2114  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
248 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
253 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
248 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
246 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
248 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
254 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
248 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>