More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1413 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
237 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  57.14 
 
 
241 aa  257  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  54.11 
 
 
234 aa  247  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  51.95 
 
 
237 aa  244  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  52.86 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  50.22 
 
 
237 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  49.12 
 
 
234 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  49.36 
 
 
236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  49.57 
 
 
237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  51.75 
 
 
231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  48.93 
 
 
236 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  48.93 
 
 
236 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  48.93 
 
 
236 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  48.93 
 
 
236 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  48.93 
 
 
236 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  49.35 
 
 
232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  48.93 
 
 
236 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  48.07 
 
 
236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  48.5 
 
 
236 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  54.15 
 
 
233 aa  215  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  47.64 
 
 
236 aa  214  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  48.07 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  51.32 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  47.64 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  47.41 
 
 
236 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  47.21 
 
 
236 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  47.41 
 
 
236 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  52.17 
 
 
242 aa  208  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  48.5 
 
 
235 aa  208  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  50.44 
 
 
234 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  47.81 
 
 
238 aa  203  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  47.39 
 
 
239 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  44.4 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  41.81 
 
 
234 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  47.39 
 
 
242 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  41.23 
 
 
232 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  44.39 
 
 
235 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  41.63 
 
 
238 aa  158  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  40.41 
 
 
231 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  37.8 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  38.31 
 
 
236 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  37.79 
 
 
231 aa  141  8e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  33.77 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  35.78 
 
 
227 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  46.37 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  35.78 
 
 
227 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  41.57 
 
 
236 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  44.37 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  36.02 
 
 
237 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  36.02 
 
 
237 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  40.11 
 
 
233 aa  129  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  37.29 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  43.18 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  36.26 
 
 
235 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  37.43 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  40.56 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  33.15 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  41.5 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  43.39 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  39.53 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  34.58 
 
 
227 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  31.94 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  35.68 
 
 
232 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  35.75 
 
 
228 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  39.02 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  41.3 
 
 
228 aa  113  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  36.72 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  43.26 
 
 
245 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  39.77 
 
 
224 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  40.29 
 
 
238 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  41.3 
 
 
228 aa  111  9e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  33.03 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  38.92 
 
 
239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  37.43 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  41.89 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  33.15 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  40.82 
 
 
231 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
261 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  40.79 
 
 
232 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  36.63 
 
 
243 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  40.76 
 
 
233 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  31.98 
 
 
245 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  36.63 
 
 
243 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  37.95 
 
 
254 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  38.54 
 
 
248 aa  101  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  30.49 
 
 
243 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  31.98 
 
 
245 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  41.36 
 
 
249 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  40.4 
 
 
218 aa  99.4  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  36.19 
 
 
247 aa  98.6  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  35.4 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  33.33 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  39.29 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  37.23 
 
 
222 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 
247 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  33.5 
 
 
222 aa  95.5  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  33.83 
 
 
252 aa  95.1  9e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2398  glutamine amidotransferase class-I  41.21 
 
 
257 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>