More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1406 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  626  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.05 
 
 
317 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  41.61 
 
 
314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  41.78 
 
 
313 aa  179  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.8 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.08 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  24.92 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  24.59 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  26.74 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.4 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  29.7 
 
 
309 aa  77  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  24.59 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  23.93 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  23.93 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  28.78 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.93 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.84 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  23.64 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  27.6 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.61 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.17 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  23.91 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.9 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.61 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  26.47 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.9 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.61 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  28.76 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  29.19 
 
 
317 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.64 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  26.42 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  23.28 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  30.93 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.93 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  30.93 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  30.93 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  30.93 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  30.93 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  30.51 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  30.88 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  30.85 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.14 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  30.43 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  27.27 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  27.4 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  24.29 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  28.31 
 
 
286 aa  67  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  23.65 
 
 
303 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  30.85 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  23.18 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  24.26 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  28.45 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  30.34 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  26.48 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  23.18 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  23.31 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  23.11 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  28.22 
 
 
308 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  23.51 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  29.05 
 
 
304 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  24.92 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  32 
 
 
306 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  29.61 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  23.47 
 
 
303 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3915  hypothetical protein  30.3 
 
 
316 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129104  normal  0.126529 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  23.71 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  25.1 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  24.12 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.39 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  24.69 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  24.26 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  23.43 
 
 
303 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  23.43 
 
 
303 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  24.12 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  23.79 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  24.12 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  30.3 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  22.85 
 
 
303 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.29 
 
 
311 aa  63.5  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  28.08 
 
 
319 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  24.44 
 
 
305 aa  63.2  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  23.47 
 
 
305 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  27.86 
 
 
307 aa  62.8  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  24.74 
 
 
299 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  27.62 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 
288 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  31.08 
 
 
255 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  30.26 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  30.47 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  30.26 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  28.29 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>