More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1369 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 177 aa  352  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  79.66 
 
 		 177 aa  288  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  68.93 
 
 		 177 aa  256  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  68.36 
 
 		 177 aa  245  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  66.1 
 
 		 177 aa  242  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  66.1 
 
 		 177 aa  242  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  64.41 
 
 		 177 aa  241  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  64.41 
 
 		 177 aa  241  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  65.54 
 
 		 177 aa  241  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  240  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  65.54 
 
 		 177 aa  239  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  64.41 
 
 		 177 aa  239  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  65.54 
 
 		 177 aa  239  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  239  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  65.54 
 
 		 177 aa  239  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  64.41 
 
 		 177 aa  239  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  64.97 
 
 		 177 aa  237  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  64.97 
 
 		 177 aa  236  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  65.54 
 
 		 177 aa  236  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  62.15 
 
 		 177 aa  235  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  234  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  233  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  231  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  62.15 
 
 		 177 aa  230  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  230  1e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  228  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  227  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  224  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  63.28 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  221  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  220  7e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  220  8e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  211  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  56 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  51.41 
 
 		 177 aa  201  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  201  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  197  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  192  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 178 aa  191  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  191  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 178 aa  190  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 178 aa  190  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1146  ribosomal protein L6  54.86 
 
 		 178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000104709  hitchhiker  0.00466337 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 178 aa  187  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0448  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 175 aa  187  9e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.935491  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  52.63 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0099  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.492804  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0509  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 175 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.910827  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0388  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  185  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000757352  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0396  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  185  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0491976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2066  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  49.71 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0616  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  50.29 
 
 		 181 aa  184  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5055  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0037225  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 178 aa  184  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  184  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0334  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000427572  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1004  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00326754  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0492  ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4228  50S ribosomal protein L6  52.12 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00495937  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 181 aa  181  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0335  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  181  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000240759  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0074  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0441  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296356  hitchhiker  0.000109216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  49.14 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0294  50S ribosomal protein L6P  51.41 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000550047  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27601  Plastid ribosomal protein L6 large ribosomal subunit  48 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.935341  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  180  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 180 aa  180  7e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 179 aa  180  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>