35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1307 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  441  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  46.72 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  46.29 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  47.6 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0151  protein of unknown function DUF540  54.76 
 
 		 240 aa  161  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.236012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  43.53 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  45.45 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  36.8 
 
 		 250 aa  141  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  42.92 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2241  hypothetical protein  44.49 
 
 		 238 aa  138  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00757602  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  38.36 
 
 		 246 aa  138  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  37.66 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  43.42 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  39.04 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  40.6 
 
 		 249 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  37.23 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  40.17 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1152  hypothetical protein  43.58 
 
 		 237 aa  131  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  35.54 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  37.34 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  39.35 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  35.12 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  38.2 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  33.05 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  39.64 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  38.56 
 
 		 250 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  33.04 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  33.9 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  31.98 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  36.02 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  31.53 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  32.14 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  31.53 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  32.45 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  31.94 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>